Note ABES Characterization of the interactome of the cytosolic dsRNA receptor Dicer-2 in vivo during viral infection in Drosophila melanogaster Caractérisation de l’interactome du récepteur d’ARNdb cytosolique Dicer-2 in vivo au cours de l’infection virale chez Drosophila melanogaster Drosophila melanogaster Drosophila C virus Spectrométrie de masse Interactome ARNdb Virus Hélicase DEAD-box ARN interférence Drosophila melanogaster Drosophila C virus Mass spectrometry Interactome DsRNA Virus DEAD-box helicase RNA interference 579.2 572.8 Drosophiles Immunologie ARN interférence Interactions ARN-protéine Le sujet de cette thèse porte sur l’immunité antivirale chez la drosophile. Mon projet principal est axé sur une protéine majeure de l’immunité antivirale chez les insectes, Dicer-2. Cette protéine est un senseur d’acides nucléiques pour la voie de l’ARN interférence (ARNi) antivirale. Dicer-2 s’associe avec et est régulé par différents partenaires, et mon but a été de comprendre comment ce réseau protéique est modulé lors de l’infection par le Drosophila C Virus (DCV). Ceci a permis l’identification de différents candidats dont j'ai pu, par la suite, confirmer l’interaction avec Dicer-2. En réalisant deux cribles ARNi, in vivo et ex vivo, j’ai pu identifier plusieurs autres candidats comme ayant un impact sur l’infection par DCV. En parallèle, j’ai travaillé sur une protéine liée à l’épissage, Fandango, qui a été identifiée comme interactant du poly(I:C) par mon laboratoire d’accueil. L’effet antiviral global de cette protéine a été mis en évidence lors d’un crible ARNi utilisant plusieurs virus. Après avoir étudié l’impact de Fandango sur l’infection par DCV, nous avons étudié son lien avec le spliceosome. Globalement, ce travail a fourni une ressource composée de différents candidats qui peuvent maintenant être étudiés plus en détails afin d’obtenir une meilleure compréhension de l’immunité antivirale chez la drosophile. The topic of this thesis is centered on antiviral immunity in D. melanogaster. My main project was focused on a major protein of insect antiviral immunity, Dicer-2. This protein is a nucleic acid sensor for the antiviral RNA interference (RNAi) pathway. Dicer-2 associates with and is regulated by several partners, and my aim has been to understand how this network is modulated by Drosophila C Virus (DCV) infection. Amongst the identified candidates, some were subsequently confirmed to interact with Dicer-2. By performing two RNAi screens, in vivo and ex vivo, I have highlighted several other proteins as having an impact on DCV infection. In parallel, I worked on a protein linked with splicing, Fandango, that was identified as a poly (I:C) interactant by my host laboratory. The global antiviral effect of this protein was shown in an ex vivo screen using different viruses. After studying the impact of Fandango on DCV infection, we attempted to determine if this impact was linked to the spliceosome. Overall, this work has provided a pool of candidates that can now be investigated further to gain a better understanding of antiviral immunity in drosophila. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 122769878 Université de Strasbourg Strasbourg 2023-12-31 https://theses.hal.science/tel-05044313 application/pdf 122717685 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2022/ROUSSEAU_Claire_2022_ED414.pdf http://www.theses.fr/2022STRAJ056/abes https://theses.hal.science/tel-05044313 https://theses.hal.science/tel-05044313 https://theses.hal.science/tel-05044313 Rousseau Claire 1996-02-10 FR 27057297X 1506015791L 21302585 4200047 https://theses.fr/2022STRAJ056 2022STRAJ056 https://doi.org/10.70675/c3d1f42cz435cz4117z826aze16a29f6c950 2022-09-30 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Meignin Carine MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 238184706 Pfeffer Sébastien MADS_PRESIDENT_DU_JURY 069221928 Castello Alfredo MADS_RAPPORTEUR_1 270573437 Jouvenet Nolwenn MADS_RAPPORTEUR_2 195239229 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Modèles Insectes de l'Immunité Innée (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 157771342 561325 ddc:570 Meignin Carine Pfeffer Sébastien Castello Alfredo Jouvenet Nolwenn École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Modèles Insectes de l'Immunité Innée (Strasbourg) PDF 122769878 confidentialité 2022-09-30 2024-12-31 confidentialité 2022-09-30 2024-12-31 restriction 2022-09-30 2024-12-31 confidentialité 2022-09-30 2024-12-31 confidentialité 2022-09-30 2024-12-31