Identification of specific phylogenetic properties of HIV-1 M and O integrases
Identification des propriétés phylogénétiques spécifiques des intégrases M et O du VIH-1
Intégrase
Intégration
VIH-1
Groupe M
Groupe O
Protéine multifonctionnelle
Évolution
SIV
Intégrase
Integration
HIV-1
Group M
Group O
Multifunctional protein
Evolution
SIV
579.2
572.8
Intégrase du VIH
Protéines virales
Phylogénie
Les transmissions de virus simiens à l'homme ont donné naissance aux différents groupes de VIH-1. Nous avons récemment identifié un motif fonctionnel (CLA), dans le domaine C-terminal de l'intégrase, essentiel pour l'intégration dans le groupe M. Ici, nous avons constaté que le motif est dispensable pour les isolats du groupe O, en raison de la présence, dans leur domaine N-terminal d'un autre motif spécifique, NOG, qui est mutuellement interchangeable avec le motif CLA. Alors que le motif NOG est déjà hautement conservé chez les ancêtres simiens du groupe O, SIVgor, chez SIVcpzPtt, l'ancêtre du VIH-1 M, aucun consensus pour le motif CLA n'est trouvé, suggérant que le motif a été sélectionné après transmission à l'homme. La caractérisation fonctionnelle des intégrases contenant le motif NOG retrace les voies mécanistes suivies par ces deux virus pour assurer une intégration efficace, améliorant notre compréhension de l'évolution des virus et de leurs protéines multifonctionnelles dans les infections humaines.
Transmissions of simian viruses to humans gave rise to the different groups of HIV-1. We recently identified a functional motif (CLA), in the C-terminal domain of integrase, essential for integration in group M. Here, we found that the motif is dispensable for isolates of group O, because of the presence, in their N-terminal domain of another specific motif, NOG, that is mutually interchangeable with the CLA motif. While the NOG motif is highly conserved already in the simian ancestors of group O, SIVgor, in SIVcpzPtt, the ancestor of HIV-1 M, no consensus for the CLA motif is found, suggesting that the motif was selected after transmission to humans. Functional characterization of NOG-motif- containing integrases traces the mechanistic paths followed by these two viruses to ensure efficient integration, improving our understanding of the evolution of viruses and of their multifunctional proteins in human infections.
Electronic Thesis or Dissertation
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en
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18035292
Université de Strasbourg
Strasbourg
2022-12-31
https://theses.hal.science/tel-03871387
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18019141
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https://theses.hal.science/tel-03871387
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Toccafondi
Elenia
1990-07-03
FR
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4200047
https://theses.fr/2022STRAJ062
2022STRAJ062
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2022-09-30
Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Strasbourg
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Doctorat
Docteur es
non
oui
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Matteo
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Dimitrova
Maria
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Etienne
Lucie
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Parissi
Vincent
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060242795
École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
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Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....)
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Negroni
Matteo
Dimitrova
Maria
Etienne
Lucie
Parissi
Vincent
École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
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