Note ABES Étude des mécanismes moléculaires régulant l’activité des complexes formés par le récepteur nucléaire ERRa Study of molecular mechanisms involved in the regulation of complexes formed by ERRa Récepteurs nucléaires ERRα PGC1-α DBD Structure Spectrométrie de masse Diffraction aux rayons X Cryo-microscopie Nuclear receptors ERRα PGC1-α DBD Structure Mass spectrometry X-ray diffraction Cryo-electron-microscopy 572.8 Récepteurs nucléaires (biochimie) Estrogènes Récepteurs Facteurs de transcription Les récepteurs nucléaires sont une famille de facteurs de transcription impliqués dans la régulation et l’adaptation de l’expression génétique. Le récepteur apparenté au récepteur aux oestrogènes alpha (ERRα) est un récepteur nucléaire orphelin constitutivement actif régulant le métabolisme énergétique et dont la dérégulation est liée à la prolifération tumorale. Cette thèse caractérise l’interaction de son domaine de liaison à l’ADN (DBD) avec ses éléments de réponses (ERRE). Elle montre que les DBDs présentent une interface de dimerisation asymétrique stable et ancestrale que ne possède pas les récepteurs oxostéroïdiens. Elle montre aussi la façon dont la forme de l’ADN dicte la liaison de ce domaine. De plus, elle s’intéresse au rôle du coactivateur-1-alpha du récepteur gamma activé par les proliférateurs du peroxysome (PGC-1a) dans l’activité transcriptionnelle de ERRα. Elle développe le fait que PGC-1α permet l’assise du second DBD sur les ERRE. Elle montre par des expériences d’échange hydrogène-deutérium, de réticulations couplées à de la spectrométrie de masse et des analyses de dispersions induites par flux que le coactivateur permet le renforcement de la liaison à l’ADN par des effets allostériques sur les LBDs et DBDs. Enfin, l’étude structurale par cryo-microscopie électronique (cryo-EM) met en lumière l’architecture globale du récepteur nucléaire, ainsi que l’orientation de ce dernier sur l’ADN. Elle met également en avant l’asymétrie des deux sous-unités de ERRa au sein du dimère actif. Nuclear receptors are a family of transcription factors involved in genetic regulation and adaptability. The estrogen-related receptor alpha (ERRα) is a constitutively active orphan nuclear receptor which regulates the energetic metabolism and for which disregulation leads to cancer proliferation. This thesis characterizes the DNA binding domain (DBD) interaction with response elements (ERRE). It shows DBD have a stable and ancestral asymmetric dimerization interface which is not encounter in oxo-steroid receptors. It shows that DNA’ shape dictates the domain binding. This thesis get interested by the role of the peroxisome proliferator- activated receptor γ coactivator 1α (PGC-1α) in ERRα transcriptional activity. It is shown at PGC-1α helps the binding of the second DBD on the ERRE. By Deuterium-Hydrogen exchanges, cross-linked mass spectrometry experiments and Flow-induced Dispersion Analysis, it is shown that PGC-1α increases the DNA binding affinity of the receptor by allosteric effects on the LBDs and DBDs. Finally, the cryo-electron-microscopy (cryo-EM) structural analysis put in light the global architecture of the nuclear receptor and its orientation compared to the DNA. The two sub-units of ERRα appears to be asymmetric inside the active dimer. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 10053305 Université de Strasbourg Strasbourg 2023-12-31 https://theses.hal.science/tel-05044459 application/pdf 10036284 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2022/VILELA_Pierre_2022_ED414.pdf http://www.theses.fr/2022STRAJ073/abes https://theses.hal.science/tel-05044459 https://theses.hal.science/tel-05044459 https://theses.hal.science/tel-05044459 Vilela Pierre 1995-01-05 FR 267284209 0106121134J 21823718 4200047 https://theses.fr/2022STRAJ073 2022STRAJ073 https://doi.org/10.70675/b838b56bz6befz49c4za4f0z6ae94cdd33ae 2022-11-25 Biophysique et biologie structurale Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Billas Massobrio Isabelle MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 238453677 Klaholz Bruno MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 148649653 Metzger Daniel MADS_PRESIDENT_DU_JURY 086804901 Housset Dominique MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 068899416 Le Maire-Coirier Albane MADS_RAPPORTEUR_1 137345410 Vénien-Bryan Catherine MADS_RAPPORTEUR_2 149644418 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 155263749 93800 ddc:570 Billas Massobrio Isabelle Klaholz Bruno Metzger Daniel Housset Dominique Le Maire-Coirier Albane Vénien-Bryan Catherine École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) PDF 10053305 confidentialité 2022-11-25 2024-11-30 confidentialité 2022-11-25 2024-11-30 confidentialité 2022-11-25 2024-11-30 confidentialité 2022-11-25 2024-11-30