Note ABES Design et synthèse de poly(phosphodiesters) numériques pour un séquençage facilité Design and synthesis of digital poly(phosphodiesters) for sequencing optimisation Polymère à séquence contrôlée Macromolécule numérique Chimie de phosphoramidite automatisée Alcoxyamine clivable Séquençage MS/MS Sequence-controlled polymers Digital macromolecules Automated phosphoramidite chemistry Cleavable alcoxyamine MS/MS sequencing 547.8 Polymères Macromolécules Alcoxyamines L’objectif de cette thèse a été de faciliter le séquençage de poly(phosphodiesters) synthétiques numériques par MS/MS et IMS à l’aide d’un nouveau marqueur clivable. Ces polymères utilisent un alphabet de monomères codants pour 0 et 1 rendant possible le stockage d’information. De tels monomères sont composés d’un groupe phosphoramidite et d’un groupe DMT, permettant d’utiliser la chimie de phosphoramidite automatisée. Afin de faciliter la lecture des polymères numériques, un nouveau design compatible avec cette chimie, incorporant une liaison fragile NO-C et un marqueur de masse a été conçu. Une première approche, motivée par sa simple mise en œuvre et ses bons rendements, a été d’utiliser un alcyne dans la structure du marqueur. Cependant, le séquençage pseudo-MS3 d’un oligomère contenant cet espaceur a été compromis à cause de sa triple liaison. La réduction de cette dernière n’a pas été encourageante, ce qui a redirigé les travaux de cette thèse vers la base structurelle d’un design antérieur alkyle du laboratoire, quant à elle efficace. Cette nouvelle stratégie a permis d’obtenir une chimiothèque de 12 marqueurs clivables. Leur incorporation en chaîne polymère uniforme, étude d’efficacité de couplage et optimisation sur un support solide universel a été décrite. The objective of this thesis was to facilitate the sequencing of synthetic digital poly(phosphodiesters) through MS/MS and IMS using a new cleavable marker. These polymers use a monomer alphabet encoding for 0 and 1, enabling information storage. Such monomers consist of a phosphoramidite group and a DMT group, allowing for automated phosphoramidite chemistry. To enhance the readability of digital polymers, a new design compatible with this chemistry, incorporating a fragile NO-C linkage and a mass tag, was devised. An initial approach, motivated by its simplicity in implementation and high yields, involved an alkyne in the marker structure. However, the pseudo-MS3 sequencing of an oligomer containing this spacer was compromised due to its triple bond. Reducing this bond did not yield promising results, redirecting the studies of this thesis toward the structural foundation of a previous laboratory design, which proved effective. This new strategy resulted in a library of 12 cleavable markers. Their incorporation into a monodisperse polymer chain, a study of coupling efficiency, and optimization on a universal solid support have been detailed. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 26999373 Université de Strasbourg Strasbourg 2024-12-31 https://theses.hal.science/tel-04961256 application/pdf 26500368 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2023/Schutz_Thibault_2023_ED222.pdf http://www.theses.fr/2023STRAF089/abes https://theses.hal.science/tel-04961256 Schutz Thibault 1996-01-23 FR 279196830 1507005978B 21420497 4200003 http://www.theses.fr/2023STRAF089 2023STRAF089 2023-12-13 Chimie des polymères Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Lutz Jean-François MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 155043420 Nierengarten Jean-François MADS_PRESIDENT_DU_JURY 070727503 Charles Laurence MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 133327922 Woisel Patrice MADS_RAPPORTEUR_1 117933848 Guillaume Sophie MADS_RAPPORTEUR_2 140092714 École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 222 156504081 Institut de science et d’ingénierie supramoléculaires (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 207480 157760227 ddc:540 Lutz Jean-François Nierengarten Jean-François Charles Laurence Woisel Patrice Guillaume Sophie École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....) Institut de science et d’ingénierie supramoléculaires (Strasbourg) PDF 26999373 confidentialité 2023-12-13 2025-01-01 confidentialité 2023-12-13 2025-01-01 confidentialité 2023-12-13 2025-01-01 confidentialité 2023-12-13 2025-01-01