Note ABES From long non-coding RNA genes to the expression of secreted effector peptides involved in Drosophila melanogaster defenses against toxins and virulence factors secreted by pathogenic microbes : the case of CG44404 and CG45045 Des gènes d’ARN long non-codant à l’expression de peptides effecteurs sécrétés impliqués dans les défenses de l’hôte contre les toxines et les facteurs de virulence sécrétés par les microbes pathogènes : cas de CR44404 et CR45045 chez Drosophila melanogaster CR45601 Yolk protein 1 CG44404 CG45045 DestruxinA ProtéaseA EnterocinV BaramicinA Protéine contenant des thioesters Vésicule de la membrane externe CR45601 Yolk protein 1 CG44404 CG45045 DestruxinA ProtéaseA EnterocinV BaramicinA Thioester containing protein Outer membrane vesicle 572.8 571.96 ARN non codants Drosophiles Immunologie Relations hôte-virus Mon doctorat visait à étudier le rôle des ARN longs non-codant (lncRNAs) dans l'immunité de la drosophile. Grâce à des données obtenues précédemment, nous avons découvert que l’expression de 23 lncRNAs étaient significativement augmentée ou diminuée lors de l'infection par l'entomopathogène Metarhizium robertsii. Dans les chapitres I et II, j’ai abordé l’étude d’un gène de chaque catégorie dont l’expression variait le plus. Dans le chapitre I, j’ai étudié le gène non codant, CR45601, dont l'expression est atténuée significativement lors de l'infection. CR45601 chevauche complètement le deuxième exon d'un gène codant, la yolk protein 1 (Yp1) dans une orientation antisens. En utilisant des mutants affectant soit Yp1 seul, soit Yp1 et CR45601 simultanément, nous n'avons pas observé de phénotypes reproductibles lors des infections testées. Dans le chapitre II, nous avons découvert que CG44404 et CG45045, qui étaient précédemment annotés comme des gènes non codants, codent en fait de courts peptides sécrétés. Nous avons révélé qu'au lieu d'agir directement contre les pathogènes eux-mêmes, les deux peptides agissent dans la défense de l'hôte contre des facteurs de virulence distincts sécrétés par des pathogènes, tels que la Destruxine A de M. robertsii, la Protéase A de Serratia marcescens et l'Entérocine V d'Enterococcus faecalis. Nos données suggèrent que les deux peptides agissent en conjonction avec un effecteur de la voie Toll, BaraA. Dans le cas de la défense contre la protéase A, une fonction de CG44404 serait de séquestrer le facteur du complément TEP2.À l'annexe I, j'ai participé à la finalisation d'une étude sur les vésicules de la membrane externe (OMV) de S. marcescens. Nous avons révélé que les OMVs déclenchent la production de ROS par les mitochondries dans les neurones et entraînent leur apoptose. En outre, nous avons découvert que la réponse cellulaire contribue à la pathogenèse des OMVs.b. Dans l'annexe II, j'ai cosigné une étude publiée révélant que BaraA protège la mouche de toxines distinctes telles que la DestruxineA et l'Enterocin V sécrétées respectivement par M. robertsii et E. faecalis. My doctoral work aimed to investigate the role of long noncoding RNAs (lncRNAs) in Drosophila immunity. Based on previous studies performed in the laboratory, we have found that the expression of 23 lncRNAs were significantly elevated or decreased upon the infection of entomopathogen Metarhizium robertsii. I worked on the most significantly and consistently suppressed and induced genes, respectively in Chapter I and Chapter II. In Chapter I, I studied the lncRNA gene CR45601, the expression of which is suppressed significantly upon infection. CR45601 completely overlaps the second exon of a coding gene yolk protein 1(Yp1) in the antisense orientation. By using the mutant depriving either Yp1 alone or both Yp1 and CR45601, we did not observe the mutant showing any reproducible phenotype in the infections we have tested. In Chapter II, we found that CG44404 and CG45045, which were previously annotated as lncRNAs, actually encode short secreted peptides. We have revealed that instead of directly attacking the pathogens, both peptides act in the host defense against distinct virulence factors secreted by pathogens, such as DestruxinA from M. robertsii, Protease A from Serratia marcescens and Enterocin V from Enterococcus faecalis. Our data suggest that both peptides function in concert with the Toll pathway effector BaraA. In the case of defense against Protease A, one function of CG44404/CG45045 may be to sequester the TEP2 complement factor. In Annex I, I was involved in finishing a study about the outer membrane vesicles (OMVs) from S. marcescens. We have discovered that OMVs trigger the production of ROS by mitochondria in neurons, resulting in the apoptosis in neurons. Besides, we have found that the cellular response from the host contributes to the pathogenesis of OMVs. In Annex II, I co-authored of a published study revealing that BaraA protects fly from distinct toxins such as Destruxin A and Enterocin V secreted by M. robertsii and E. faecalis respectively. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 23887253 Université de Strasbourg Strasbourg 2023-12-31 https://theses.hal.science/tel-05104570 application/pdf 23864669 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2023/CAI_Chuping_2023_ED414.pdf http://www.theses.fr/2023STRAJ012/abes https://theses.hal.science/tel-05104570 https://theses.hal.science/tel-05104570 https://theses.hal.science/tel-05104570 Cai Chuping 1994-09-28 FR 27099050X 213177335FA 22126458 4200047 https://theses.fr/2023STRAJ012 2023STRAJ012 https://doi.org/10.70675/ba8e63f2z2368z4e64z976bze36b81693c3a 2023-06-01 Aspects moléculaire et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Guangzhou Medical University MADS_ETABLISSEMENT_DE_COTUTELLE_1 261564471 Doctorat Docteur es non oui Ferrandon Dominique MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 081351097 Jiao Renjie MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 241122694 Marteyn Benoît MADS_PRESIDENT_DU_JURY 144481820 Li Zi MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 265760534 Wang Chengshu MADS_RAPPORTEUR_1 270994297 Lemaitre Bruno MADS_RAPPORTEUR_2 074758306 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Modèles Insectes de l'Immunité Innée (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 157771342 561325 ddc:570 Guangzou Medical University Ferrandon Dominique Jiao Renjie Marteyn Benoît Li Zi Wang Chengshu Lemaitre Bruno École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Modèles Insectes de l'Immunité Innée (Strasbourg) PDF 23887253 confidentialité 2023-06-01 2025-06-01 confidentialité 2023-06-01 2025-06-01 restriction 2023-06-01 2025-06-01 confidentialité 2023-06-01 2025-06-01 confidentialité 2023-06-01 2025-06-01