Étude d’éléments cis-régulateurs de l’initiation de la traduction eucaryote par des méthodes in vitro et par des méthodes de criblage à haut-débit
Langue Français
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Auteur : Tidu, Antonin
Date de soutenance : 20-01-2023

Directeur(s) de thèse : Martin, Franck

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Initiation de la traduction, Ribosome, Cis-régulation, Séquence Kozak, Codons non-AUG, Virus, IRES
Mots-clés :
  • Codons
  • Traduction génétique
  • Séquence nucléotidique
Résumé : Le premier volet de ce travail est dédié à la recherche de séquences qui modulent la reconnaissance du codon initiateur par le ribosome. L’analyse des résultats de criblages de banques d’ARN rapporteurs portant des contextes nucléotidiques randomisés autour du codon AUG initiateur, ainsi que l’analyse, en parallèle, des contextes des codons AUG initiateurs des phases codantes humaines, suggèrent l’absence de motif minimal autour du codon AUG permettant d’expliquer son utilisation par le ribosome. Quant à l’initiation sur un codon non-AUG, les résultats montrent qu’elle est favorisée par la présence d’une structure d’ARN assez stable située en aval. Le second volet est dédié à la mise au point d’une méthode de criblage permettant d’identifier des IRES dans un génome viral. Une expérience de preuve de concept sur un génome viral modèle a montré que la méthode permet d’identifier les deux IRES qui s’y trouvent. Enfin, l’étude de la traduction de l’ARN du SARS-CoV-2 a montré qu’elle nécessite la structure en tige-boucle à son extrémité 5’ en présence de la protéine virale NSP1 qui invalide les ribosomes, permettant ainsi la traduction sélective de l’ARN viral.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2023STRAJ033
Type de ressource : Thèse