Note ABES An NMR study of the effects of fluorinated prolines on proteins properties Étude par RMN des effets de l’insertion d’un atome de fluor sur les propriétés des prolines au sein des protéines Proline RMN Fluor Fluoroproline NCBD Globule fondu Poly proline Proline NMR Fluorine Fluoroproline NCBD Molten globule Polyproline 572.33 546.731 547.02 Proline Stéréochimie Fluor La proline est un acide aminé particulier qui peut adopter deux conformères non planaires ςγ endo et ςγ exo et qui peuple de manière significative l’isomère cis comparé à tous les autres acides aminés naturels. La conformation du cycle, les populations cis et trans ainsi que la cinétique de ces événements peuvent être biaisées en remplaçant un atome d'hydrogène par un atome de fluor dans la proline. 4R et 4S fluoroprolines sont utilisées d’abord comme sondes atomiques de la structure, la dynamique et les interactions des peptides suivies par la RMN de fluor et ensuite pour explorer le lien fonctionnel entre les propriétés de la proline et la fonction protéique. Deux systèmes biologiques ont été étudié, le premier est un peptide modèle riche en poly proline qui se lit au domaine SH3 et le deuxième est un globule fondu NCBD de la protéine CBP. Les variants fluorés de chaque système ont été étudiés en détail dans leurs formes isolées ainsi qu'en complexe avec leurs partenaires de liaison. Proline is a particular amino acid that can adopt two non-planar conformers ςγ endo and ςγ exo, and that significantly populates the cis isomer compared to all other natural amino acids. The ring puckering, cis and trans populations as well as the kinetics of these events can be biased by replacing a hydrogen atom with a fluorine atom in proline. 4R and 4S fluoroprolines are used first as atomic probes of peptide structure, dynamics and interactions followed by fluorine NMR and then to explore the functional link between proline properties and protein function. Two biological systems were studied, the first is a poly proline-rich model peptide that binds to the SH3 domain, the second is the molten globule NCBD of the CBP protein. The fluorinated variants of each system have been studied in detail in their isolated forms as well as in complex with their binding partners. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 60917444 Université de Strasbourg Strasbourg 2023-12-31 application/pdf 20122921 http://www.theses.fr/2023STRAJ039/document http://www.theses.fr/2023STRAJ039/abes Ben Bouzayene Abir 1995-02-22 FR 27167539X 0EFB1S08OI4 21726921 4200047 http://www.theses.fr/2023STRAJ039 2023STRAJ039 2023-06-27 Chimie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Kieffer Bruno MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 074333453 Torbeev Vladimir MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 231409664 Sizun Christina MADS_PRESIDENT_DU_JURY 184765625 Landrieu Isabelle MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 076929647 Zanier Katia MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 236279076 Sizun Christina MADS_RAPPORTEUR_1 184765625 Miclet Emeric MADS_RAPPORTEUR_2 194674401 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 155263749 93800 ddc:570 ddc:540 Kieffer Bruno Torbeev Vladimir Sizun Christina Landrieu Isabelle Zanier Katia Sizun Christina Miclet Emeric École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) PDF 60917444 confidentialité 2023-06-27 2026-07-31 confidentialité 2023-06-27 2026-07-31 confidentialité 2023-06-27 2026-07-31 confidentialité 2023-06-27 2026-07-31