Adaptation de 'Pseudomonas aeruginosa' à l’acquisition du fer : modélisation mathématique des switchs phénotypiques
Iron acquisition in 'Pseudomonas aeruginosa' : mathematical modelling of phenotypic switches
Pseudomonas aeruginosa
Homéostasie du fer
Sidérophore
Transporteur TonB-dépendant
Modélisation mathématique
Pseudomonas aeruginosa
Iron homeostasis
Siderophore
TonB-dependent transporter
Mathematical modelling
579.332
571.64
Pseudomonas aeruginosa
Transport biologique
Sidérophores
Fer dans l'organisme
Le fer est un nutriment essentiel à la croissance bactérienne et les bactéries produisent de petites molécules appelées sidérophores pour l’acquérir. Pseudomonas aeruginosa peut exprimer au moins 15 voies d’acquisition du fer impliquant deux sidérophores endogènes et de nombreux sidérophores exogènes produits par d’autres bactéries. Toutes ces voies, sauf une, impliquent un transporteur TonB-dépendant (TBDT) pour importer le fer à travers la membrane externe. Des rapporteurs fluorescents ont été développés pour suivre l'expression des TBDT impliqués dans ces voies. Ces rapporteurs ont été validés puis utilisés pour étudier l'expression des TBDT de voies endogènes et exogènes d'acquisition du fer en présence de gradients de concentrations de sidérophores seuls, en mélange ou présents dans des surnageants de cultures bactériennes. Les données obtenues ont permis de construire des modèles mathématiques pour caractériser les schémas d'expression de ces transporteurs.
Iron is an essential nutrient for bacterial growth. In order to access this nutrient, bacteria produce siderophores, which are small molecules with a high affinity for iron. Pseudomonas aeruginosa can express at least 15 different iron acquisition pathways involving two endogenous siderophores and numerous exogenous siderophores produced by other bacteria. All but one of these pathways involve a TonB-dependent transporter (TBDT) to import iron across the outer membrane. Fluorescent reporters have been developed to monitor the expression of TBDTs involved in these pathways. These reporters were validated and used to study the expression of TBDTs from endogenous and exogenous iron acquisition pathways in the presence of concentration gradients of one siderophore, mixtures of siderophores, or siderophores in bacterial culture supernatants. The data obtained allowed the construction of mathematical models to characterize the expression patterns of these transporters.
Electronic Thesis or Dissertation
Text
fr
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8020361
Université de Strasbourg
Strasbourg
2023-12-31
https://theses.hal.science/tel-04643675
application/pdf
7794041
https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2023/HUBERT_Thibaut_2023_ED414.pdf
https://theses.fr/2023STRAJ040/abes
https://theses.hal.science/tel-04643675
https://theses.hal.science/tel-04643675
Hubert
Thibaut
1994-11-03
FR
272426474
1205022618U
21414399
4200047
https://theses.fr/2023STRAJ040
2023STRAJ040
https://doi.org/10.70675/0a595e05za7c3z4e76z9ee3z71b001c8e3d5
2023-09-18
Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Strasbourg
131056549
Doctorat
Docteur es
non
oui
Schalk
Isabelle
MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1
148937055
Madec
Morgan
MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2
135406242
Sabatier
Laurence
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098472992
Manfredi
Pablo
MADS_MEMBRE_DU_JURY_1
27242689X
Arnoux
Pascal
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08652819X
Izadi-Pruneyre
Nadia
MADS_RAPPORTEUR_2
125364067
École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
MADS_ECOLE_DOCTORALE_1
414
156502844
Biotechnologie et signalisation cellulaire (Strasbourg ; 2011-....)
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207563
Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (Strasbourg ; 2013-....)
MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_2
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217648
ddc:570
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Morgan
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Pablo
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Pascal
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Biotechnologie et signalisation cellulaire (Strasbourg ; 2011-....)
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