Note ABES Role of human Dicer helicase domain upon viral infection Rôle du domaine hélicase de la protéine Dicer humaine lors de l’infection virale Dicer Virus ARNi Réponse interféron PKR NF-kB Dicer Viruses RNAi Interferon response PKR NF-kB 572.6 572.8 Protéines virales ARN interférence Réponse immunitaire Les cellules eucaryotes font face aux infections virales grâce à deux réponses immunitaires : l’interférence à l’ARN (ARNi) chez les invertébrés et les plantes et la réponse interféron de type I (IFN-I) chez les mammifères. Chez ces derniers, le rôle de l’ARNi dans la réponse antivirale est débattu, malgré la présence d’une machinerie active. Dans le cadre de ce projet, j’ai étudié le rôle du domaine hélicase du Dicer humain lors de l’infection virale. Le domaine hélicase permet l’interaction avec de nombreux partenaires de la voie de l’IFN-I dont la kinase PKR, qui est alors régulée. De plus, un mutant de délétion de ce domaine, Dicer N1, est antiviral contre les alphavirus et les enterovirus et cela indépendamment de son activité catalytique. J’ai montré que la présence de PKR mais pas de son activité catalytique est nécessaire à l’activité antivirale de N1. De plus, dans les cellules N1 non infectées, un groupe de gènes liés à la réponse antivirale est sur-exprimé et sous contrôle de facteurs de transcription de l’immunité dont NF-kB. J’ai ainsi identifié un rôle non-canonique du domaine hélicase de Dicer qui renforce l’idée d’une connexion entre ARNi et IFN-I. Eukaryotic cells face viral infections through two immune responses: RNA interference (RNAi) in invertebrates and plants, and the type I interferon (IFN-I) response in mammals. In mammals, the role of RNAi in the antiviral response is debated, despite the presence of an active machinery. In this project, I investigated the role of the helicase domain of human Dicer during viral infection. The helicase domain allows interaction with numerous IFN-I-derived partners, including the PKR kinase, which is thus regulated. In addition, a deletion mutant of this domain, Dicer N1, is antiviral against alphaviruses and enteroviruses, independently of its catalytic activity. I have shown that the presence of PKR but not its catalytic activity is necessary for the antiviral activity of N1. Furthermore, in uninfected N1 cells, a group of genes linked to antiviral defense is over-expressed and under the control of immune transcription factors including NF-kB. I have thus identified a non-canonical role for Dicer helicase domain, reinforcing the idea of a crosstalk between RNAi and IFN-I. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 80935324 Université de Strasbourg Strasbourg 2023-12-31 https://theses.hal.science/tel-04892000 application/pdf 80316126 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2023/BALDACCINI_Morgane_2023_ED414.pdf http://www.theses.fr/2023STRAJ047/abes https://theses.hal.science/tel-04892000 https://theses.hal.science/tel-04892000 Baldaccini Morgane 1997-06-16 FR 264916808 0607018449M 21704960 4200047 https://theses.fr/2023STRAJ047 2023STRAJ047 https://doi.org/10.70675/784a3183zaa60z4105z8bdazca4d777fd878 2023-09-21 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Pfeffer Sébastien MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 069221928 Meignin Carine MADS_PRESIDENT_DU_JURY 238184706 Maillard Pierre MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 272832367 Etienne Lucie MADS_RAPPORTEUR_1 241056950 Van Rij Ronald P. MADS_RAPPORTEUR_2 151817723 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 157545687 93780 ddc:570 Pfeffer Sébastien Meignin Carine Maillard Pierre Etienne Lucie Van Rij Ronald P. École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....) PDF 80935324 confidentialité 2023-09-21 2024-12-31 confidentialité 2023-09-21 2024-12-31 confidentialité 2023-09-21 2024-12-31 confidentialité 2023-09-21 2024-12-31