Identification de facteurs cellulaires et viraux interagissant avec la protéine Readthrough (RT) du turnip yellows virus
Langue Français
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 30/09/2025.
  • Thèse soumise à l'embargo de l'auteur jusqu'au 30/09/2025 (communication intranet).
 
Auteur : Kiervel, Déborah
Date de soutenance : 22-09-2023

Directeur(s) de thèse : Ziegler-Graff, Véronique

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé

Mots-clés libres : Polerovirus, TuYV, RT, IPP, IP-MS/MS, Localisation subcellulaire
Mots-clés :
  • Relations hôte-virus
  • Interactions protéine-protéine
  • Protéines virales
Résumé : Les interactions protéine-protéine (IPP) entre l’hôte et les virus jouent un rôle majeur dans l’établissement des cycles viraux et dans la pathogenèse associée à l’infection. L’identification des ces IPP s’est ainsi imposée comme une nouvelle stratégie de recherche pour l’étude avancée du rôle des protéines dans les cycles viraux et la recherche guidée de nouvelles cibles pour la lutte antivirale. Mes travaux de thèse ont ainsi porté sur l’identification du réseau d’IPP de la protéine multifonctionnelle Readhthrough (RT) du turnip yellows virus(TuYV), un phytovirus phloémien appartenant au genre des Polerovirus. J’ai entrepris d’identifier à haut débit et sans a priori les interactants cellulaires de la protéine RT chez les plantes hôte A. thaliana et N. benthamiana grâce à la technique de co-immunoprécipitation (co-IP) couplée à la spectrométrie de masse en tandem (MS/MS). Ces expériences ont été conduites lorsque la protéine RT était exprimée hors ou en contexte viral. A l’issue de ces analyses nous avons sélectionnés différents partenaires cellulaires en vue de tester leur IPP directe avec cette protéine virale par deux autres approches : le FRET-FLIM et le double hybride de levure (Y2H). Parmi ces candidats, j’ai démontré une IPP directe entre la protéine RT, la protéine majeure de capside CP et les quatre protéines nucléaires ALY d’A. thaliana qui participent à l’export nucléo-cytoplasmique des ARNm cellulaires. Parallèlement à ces travaux, j’ai initié l’étude du rôle de la protéine RT en analysant sa localisation subcellulaire par microscopie confocale. Ces analyses ont permis de démontrer que la protéine RTdu TuYV possède une localisation ponctuée à la membrane plasmique et dans des structures apparentées à des organites liquides formés par séparation de phase liquide-liquide (LLPS). Cette localisation semblant attribuée au domaine C-ter de cette protéine virale. Finalement, j’ai caractérisé pour la première fois la formation de structures périnucléaires induites par l’infection virale qui semblent apparentées à des complexes de réplication dans lesquels plusieurs protéines associées à la réplication du TuYV et la protéine RT sont localisées.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2023STRAJ055
Type de ressource : Thèse