Note ABES Species-wide survey of transcript and protein abundance variation in yeast Analyse de la variation de l’abondance des transcrits et des protéines à l’échelle de l’espèce chez la levure Génétique Expression des gènes Protéomique Transcriptomique Étude des populations Genetics Gene expression Proteomic Transcriptomic Population-scale 572.8 Transcription génétique Saccharomyces cerevisiae Génétique ARN -- Modifications posttranscriptionnelles Une importante diversité phénotypique peut être observée au sein des populations naturelles. L'un des principaux objectifs de la biologie moderne est d'élucider les origines génétiques de cette diversité. L'expression des gènes est l’un des principaux acteurs de la relation entre les génotypes et les phénotypes. Au cours des dernières décennies, plusieurs avancées analytiques et techniques ont permis d'étudier l'expression des gènes à chaque étape du processus d'expression et à très grandes échelles. Cependant, aucune exploration complète de l'expression des gènes à travers l'ensemble du processus et à l'échelle des populations n’a à ce jour été réalisée. L'objectif de cette thèse est d'obtenir une vision plus complète de la façon dont chaque niveau de l'expression de gène varie, s'influence mutuellement et est liée à la diversité génétique naturelle observée au sein des espèces. Pour ce faire, nous avons analysé les transcriptomes et les protéomes d'une population naturelle de S. cerevisiae et avons observé d’importantes différences entre la régulation de l'abondance des ARNm et des protéines. En parallèle, nous avons étudié le processus d'expression des gènes à trois niveaux moléculaires différents et découvert que d'importants mécanismes d’atténuation impactent les variations d'expression entre les individus. An astonishing phenotypic diversity can be observed in natural populations. One of the major goals of modern biology is to unravel the genetic origins of this phenotypic landscape. Gene expression is known to be a main determinant of the relationship between genotypes and phenotypes. In recent decades, several analytical and technical advances have made it possible to study gene expression at every step of the expression process and at very large scales. However, a complete exploration of gene expression across the entire process and at the population scale is still lacking. The goal of this dissertation is to get a more comprehensive view of how each layer of gene expression varies, influences each other, and is related to the natural genetic diversity observed within species. To this end, we analyzed the transcriptomes and proteomes of a large natural population of S. cerevisiae and found unsuspected differences between mRNA and protein abundance regulation. Simultaneously, we studied the gene expression process at three different molecular levels and found that important buffering mechanisms underlie the expression variation between individuals. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 33055218 Université de Strasbourg Strasbourg 2023-12-31 https://theses.hal.science/tel-04356542 application/pdf https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2023/Teyssonniere_Elie_2023_ED414.pdf http://www.theses.fr/2023STRAJ069/abes https://theses.hal.science/tel-04356542 https://theses.hal.science/tel-04356542 https://theses.hal.science/tel-04356542 https://theses.hal.science/tel-04356542 Teyssonnière Élie 1993-10-09 FR 273972561 0804006528P 21700051 4200047 https://theses.fr/2023STRAJ069 2023STRAJ069 https://doi.org/10.70675/9c5f617cz3bcfz4064z9e8eza0b9f5bca082 2023-10-20 Sciences de la vie et de la santé Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Schacherer Joseph MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 101873336 Friedrich Anne MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 128643811 Knop Michael MADS_PRESIDENT_DU_JURY 16415986X Blandin Stéphanie MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 086314246 Mar Albà Maria MADS_RAPPORTEUR_1 273972901 Diss Guillaume MADS_RAPPORTEUR_2 27397307X École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Génétique moléculaire, génomique et microbiologie (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 156733447 93783 ddc:570 Schacherer Joseph Friedrich Anne Knop Michael Blandin Stéphanie Mar Albà Maria Diss Guillaume École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Génétique moléculaire, génomique et microbiologie (Strasbourg) PDF 33055218