Analyses multi-omiques et fonctionnelles du carcinome rénal à cellules claires (CCRcc) et du carcinome rénal à translocation (CRT)
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 01/01/2028.
 
Auteur : Helleux, Alexandra
Date de soutenance : 27-10-2023

Directeur(s) de thèse : Davidson, Irwin - Malouf, Gabriel

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Médecine et santé

Mots-clés libres : CCRcc, Hétérogénéité, Fibroblastes, EMT, CRT, TFE3, OxPhos
Mots-clés :
  • Carcinome rénal à cellules claires - Génétique
  • Translocation (génétique)
  • Micro-environnement tumoral
Résumé : Ce travail de thèse s’articule autour de deux projets indépendants dont le but est de mieux caractériser les mécanismes oncogéniques impliqués dans deux sous-types de carcinomes à cellules rénales (CCR) par l’utilisation de plusieurs techniques de séquençage. D’une part, les CCR à cellules claires (CCRcc), les CCR les plus fréquents, sont les mieux caractérisés mais la plasticité des cellules tumorales reste encore à mieux définir. Ainsi, nous avons pu mettre en évidence l’hétérogénéité tumorale et la transformation de cellules tumorales épithéliales en cellules mésenchymateuses (EMT) dans CCRcc grâce à l’analyse de 7 tumeurs par séquençage d’ARN de cellules uniques (scRNAseq). Cette étude a également révélé la collaboration et la proximité spatiale des cellules tumorales mésenchymateuses, les plus agressives, avec les fibroblastes-associés-au-cancer myofibroblastiques, et leur association avec la mauvaise survie des patients et la résistance aux thérapies d’inhibiteur de checkpoint immunitaire. D’autre part, les carcinomes rénaux à translocation (CRT), représente une entité rare et peu caractérisée de CCR définie par l’expression d’une protéine de fusion anormale mais fonctionnelle impliquant le facteur TFE3. Des analyses de perte et gain de fonction dans des lignées cellulaires de CRT et des approches multi-omiques (RNAseq, ChIPseq, scRNAseq), nous ont permis de mettre en évidence la prédominance de la phosphorylation oxydative (OxPhos) dans le métabolisme des CRT, process régulé directement par les protéines de fusion de TFE3. Cette importance de l’OxPhos a été confirmée dans une cohorte de patients qui nous a également permis d’identifier les cas de CRT les plus agressifs caractérisés, là aussi, par une EMT.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : not initialized
Identifiant : 2023STRAJ085
Type de ressource : Thèse