Exploration de familles non-résolues avec déficience intellectuelle présumée liée à l’X à l’ère du Whole Genome Sequencing
Langue Français
Accéder au document

Ce document est protégé en vertu du Code de la Propriété Intellectuelle.

 
Auteur : Djebbar El Chehadeh, Salima
Date de soutenance : 30-11-2023

Directeur(s) de thèse : Piton, Amélie

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé

Mots-clés libres : Déficience intellectuelle liée à l’X, Séquençage de génome entier, Gène SLITRK2
Mots-clés :
  • Déficience intellectuelle - Génétique
  • Projet Génome humain
  • Expression génique
Résumé : La déficience intellectuelle (DI) concerne 2% de la population et représente la première cause de consultation dans les centres de génétique pédiatriques. Plus de la moitié des causes de DI sont génétiques, avec près de 1500 gènes impliqués, dont 127 gènes situés sur le chromosome X, et 200 syndromes recensés. On estime qu’environ 21% des syndromes avec DI liée à l’X (DILX) restent irrésolus sur le plan moléculaire. Des gènes de DILX et des mécanismes mutationnels encore non décrits sur l’X restent donc probablement à identifier. Ce travail de doctorat a en partie consisté à séquencer le génome (WGS) de patients atteints de DI présumée liée à l’X dont les analyses génétiques antérieures étaient négatives, ce qui a permis de contribuer à la validation de nouveaux gènes candidats de DILX, tel que le gène SLITRK2. Il souligne les difficultés rencontrées lors de l’interprétation des données de WGS, en particulier l’identification des variants non-codants et le très grand nombre de variants à analyser. De plus, l’interprétation des variants faux-sens sur des gènes de l’X est délicate en l’absence de ségrégation familiale concluante et d’étude fonctionnelle disponible.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2023STRAJ097
Type de ressource : Thèse