Note ABES Caractérisation du rôle de l’exoribonucléase DIS3L2 et du complexe protéique SKI lors d’une infection virale Characterization of the role of the exoribonuclease DIS3L2 and the SKI protein complex during viral infection Dégradation des ARN Complexe SKI Exoribonucléase DIS3L2 Virus de Sindbis RNA degradation SKI complex Exoribonuclease DIS3L2 Sindbis virus 572.8 572.6 Cellules eucaryotes Virus à ARN monocaténaire Ribonucléases Chez les eucaryotes, les voies de dégradation des ARN régulent l'abondance des transcrits et assurent un contrôle qualité en éliminant les ARN défectueux. Le complexe SKI agit dans le cytoplasme en tant que co-facteur de l'exosome, stimulant la dégradation des ARN par leur extrémité 3'. La ARN de 3' en 5' est également assurée par l'exoribonucléase DIS3L2. Dans le cadre de notre proiet, nous avons étudié le rôle de DIS3L2 et du complexe SKI lors d'une infection par le virus de Sindbis (SINV) dans des lignées mutantes pour ces facteurs protéiques. Nos résultats indiquent un effet limité de DIS3L2 sur l'infection virale. Néanmoins, nous avons démontré que les lignées n'exprimant plus SKIC2 et SKIC3, deux des sous-unités du complexe SKI, présentent une baisse significative de l'infection virale. Ceci suggère un effet proviral de ces deux protéines lors de l'infection par le SINV, une hypothèse qui a été confirmée par d'autres approches d'extinction de gènes (siARN). Ensuite, nous avons restauré l'expression de SKIC2 et nous avons démontré que l'effet proviral observé est bien attribuable à SKIC2. Une analyse plus approfondie des mécanismes moléculaires, notamment par l'analyse des interactions protéiques modulées par l'infection par le SINV, devrait nous permettre de mieux comprendre le rôle du complexe SKI lors d'une infection virale. In eukaryotes, RNA degradation pathways regulate the abundance of transcripts and perform quality control by eliminating defective RNA. The SKI complex, active in the cytoplasm, functions as a co-factor of the exosome, promoting RNA degradation from their 3' end. This degradation is also ensured by the exoribonuclease DIS3L2. In the context of our project, we explored the role of DIS3L2 and the SKI complex during infection by the Sindbis virus (SINV) in cell lines mutated for these proteins. Our results show a limited effect of DIS3L2 on viral infection. However, we observed that cell lines no longer expressing SKIC2 and SKIC3, two subunits of the exosome, show a significant decrease in viral infection. This suggests a proviral role for these two proteins during SINV infection, a hypothesis confirmed by other gene silencing methods (siRNA). After restoring the expression of SKIC2, we validated that the observed proviral effect is directly linked to SKIC2. A more in-depth analysis of the molecular mechanisms, particularly the protein interactions modified by SINV infection, should allow us to better understand the role of the SKI complex during viral infection. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 8103300 Université de Strasbourg Strasbourg 2024-12-31 https://theses.hal.science/tel-04946185 application/pdf 109779375 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2023/AMRANI_Yasmine_2023_ED414.pdf http://www.theses.fr/2023STRAJ113/abes https://theses.hal.science/tel-04946185 https://theses.hal.science/tel-04946185 Amrani Yasmine 1997-01-03 FR 275886891 0756AP008F1 21805786 4200047 https://theses.fr/2023STRAJ113 2023STRAJ113 https://doi.org/10.70675/8336a67ez200ez4517zb8cdz59f890493e99 2023-10-13 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Pfeffer Sébastien MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 069221928 Séraphin Bertrand MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 034167617 Dimitrova Maria MADS_PRESIDENT_DU_JURY 204203112 Briant Laurence MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 086288083 Muylkens Benoit MADS_RAPPORTEUR_1 229792251 Demeret Caroline MADS_RAPPORTEUR_2 17564165X École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 157545687 93780 ddc:570 Pfeffer Sébastien Séraphin Bertrand Dimitrova Maria Briant Laurence Muylkens Benoit Demeret Caroline École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....) PDF 8103300 confidentialité 2023-10-13 2024-12-31 confidentialité 2023-10-13 2024-12-31 confidentialité 2023-10-13 2024-12-31 confidentialité 2023-10-13 2024-12-31