Note ABES Study of the role of Nejire in Drosophila immune response Étude du rôle de Nejire dans la réponse immunitaire innée chez la drosophile Drosophila melanogaster Épigénétique Réponse immunitaire innée NF-kB Nejire Identité cellulaire Rad50 RNA-seq Drosophila melanogaster Epigenetics Innate immune response NF-kB Nejire Cell identity Rad50 RNA-seq 571.96 572.8 Réponse immunitaire Modèles animaux Facteur de transcription NF-κB Drosophila melanogaster Résistance aux maladies Génétique moléculaire L'immunité innée est un mécanisme de défense fondamental présent chez tous les métazoaires. Cependant, son activation incontrôlée peut conduire à une inflammation chronique et à des maladies graves. Les voies NF-κB, centrales dans la réponse immunitaire innée, sont conservées entre les insectes et les mammifères, faisant de la mouche Drosophile un organisme modèle essentiel pour étudier ces voies. En combinant des approches génétiques et des techniques de séquençage à haut débit, j’ai pu préciser le rôle de l’histone acétyltransférase Nejire — un homologue de CBP/P300— dans la régulation de la voie NF-kB IMD. J'ai pu démontrer le rôle de Nejire dans le contrôle d'au moins un régulateur négatif, PGRP-LB, contribuant ainsi au contrôle précis de cette voie immunitaire. J’ai été associé à un second projet, qui visait à définir les profils transcriptionnels qui définissent l'identité des neurones, des cellules gliales et des hémocytes chez la drosophile au cours du développement. En partant d’une analyse combinatoire de donnée de RNA-seq, nous avons identifié l'enzyme de réparation de l'ADN Rad50 comme un acteur potentiel participant à la structuration de la chromatine pendant le développement, définissant ainsi un nouveau paramètre temporel de l’identité cellulaire. The innate immunity is a fundamental defense mechanism present across metazoans. Its uncontrolled activation can be deleterious and cause chronic inflammation leading to severe diseases. The NF-kB pathways, central to the innate immune response are conserved in insects and mammals, making Drosophila melanogaster an important model for their study. Combining genetic approaches with high throughput sequencing, I characterized the role of the histone acetyltransferase Nejire –the Drosophila homologue of mammalian CBP/P300– in the control of the NF-kB IMD pathways. I could demonstrate that Nejire is involved in the regulation of at least one negative regulator, PGRP-LB, thus participating to the tight control of this immune pathway. I was involved in a second project which aimed to identify stage-specific transcriptional signatures that defines Drosophila neurons, glia and hemocyte identity. Starting from a combinatorial analysis of RNA-seq, we could identify the DNA repair enzyme Rad50 as an unexpected temporal parameter in the definition of cell identity. More precisely, we identified Rad50 as putative chromatin domain binding protein, further highlighting the crosstalk between DNA repair and transcriptional regulation. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 17153526 Université de Strasbourg Strasbourg 2024-12-31 application/pdf 17142219 http://www.theses.fr/2023STRAJ142/document http://www.theses.fr/2023STRAJ142/abes Boutet Thomas 1990-04-09 FR 280042345 1504002918F 40801139 4200047 https://theses.fr/2023STRAJ142 2023STRAJ142 https://doi.org/10.70675/d5de325fz5272z4e6bzb317z553bf49f644b 2023-12-05 Sciences de la vie et de la santé Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Matt Nicolas MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 10921711X Giangrande Angela MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 033789231 Ferrandon Dominique MADS_PRESIDENT_DU_JURY 081351097 El Chamy Laure MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 139641998 Mannervik Mattias MADS_RAPPORTEUR_1 280063164 Waltzer Lucas MADS_RAPPORTEUR_2 110951778 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 155263749 93800 ddc:570 Matt Nicolas Giangrande Angela Ferrandon Dominique El Chamy Laure Mannervik Mattias Waltzer Lucas École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) PDF 17153526 confidentialité 2023-12-05 2026-12-05 confidentialité 2023-12-05 2026-12-05 confidentialité 2023-12-05 2026-12-05 confidentialité 2023-12-05 2026-12-05