Note ABES Etudes des relations structure-fonction de catalyseurs protéiques conçus de novo pour les réactions de transfert d’acyle Study of structure-function relationships of de novo designed protein catalysts for acyl transfer reactions Conception de protéines de novo Synthèse totale de protéines Thiol aromatique Mécanisme compétitif De novo protein design Total synthesis of proteins Aryl-thiol Competitive mechanism 547.7 Protéines Conception technique Synthèse protéique Thiols Le but de cette thèse est d’explorer les relations structure/propriétés de protéines de novo capables de catalyser efficacement le transfert de groupes acyles, notamment la formation de liaisons amide entre deux peptides par NCL en conditions natives et à des concentrations sub-milimolaires. En utilisant différents types de thiols comme résidus catalytiques, nous avons démontré la capacité de modifier les propriété de ces catalyseurs. Nous avons introduit un second site catalytique et avons tenté d’orienter le mécanisme d’un fonctionnement compétitif à un fonctionnement coopératif. Les résultats obtenus représentent une avancée significative vers le développement de futurs catalyseurs protéiques pour la ligation et la cyclisation de peptides. The goal of this thesis is to explore the structure/property relationships of de novo proteins capable of efficiently catalyzing the transfer of acyl groups, particularly the formation of amide bonds between two peptides through Native Chemical Ligation (NCL) under native conditions and at sub-millimolar concentrations. By using different types of thiols as catalytic residues, we demonstrated the ability to modify the properties of these catalysts. We introduced a second catalytic site and attempted to shift the mechanism from a competitive to a cooperative function. The results obtained represent a significant advancement toward the development of future protein catalysts for peptide ligation and cyclization. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 17662034 application/pdf 17544158 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2024/Bachelart_Thomas_2024_ED222.pdf http://www.theses.fr/2024STRAF041/abes Bachelart Thomas 1996-03-30 FR 28269854X 2407025351D 22026665 4200003 https://theses.fr/2024STRAF041 2024STRAF041 https://doi.org/10.70675/f20fb476z4247z4651zbdf6zd3e56e5fcfaa 2024-09-27 Chimie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Torbeev Vladimir MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 231409664 Aucagne Vincent MADS_PRESIDENT_DU_JURY 077138120 Gavériaux-Ruff Claire MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 033786941 Aucagne Vincent MADS_RAPPORTEUR_1 077138120 Agouridas Vangelis MADS_RAPPORTEUR_2 235848522 École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 222 156504081 Institut de science et d’ingénierie supramoléculaires (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 207480 157760227 ddc:540 Torbeev Vladimir Aucagne Vincent Gavériaux-Ruff Claire Aucagne Vincent Agouridas Vangelis École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....) Institut de science et d’ingénierie supramoléculaires (Strasbourg) PDF 17662034 confidentialité 2024-09-27 2029-09-27 confidentialité 2024-09-27 2029-09-27 restriction 2024-09-27 2029-09-27 confidentialité 2024-09-27 2029-09-27 confidentialité 2024-09-27 2029-09-27