Note ABES Determination of pericentric heterochromatin structure by in situ cryo-electron tomography La détermination de la structure de l’hétérochromatine péricentrique en utilisant la tomographie cryo-électronique in situ Hétérochromatine Silençage épigénétique Nucléosome Microscopie optique et électronique corrélative Tomographie cryo-électronique Heterochromatin Epigenetic silencing Nucleosome Correlative light and electron microscopy Cryo-electron tomography. 572.8 571.4 Hétérochromatine Expression génique Cryoélectronique Transcription génétique L'hétérochromatine constitutive est une forme condensée de chromatine, essentielle au maintien de la stabilité du génome et à la défense contre les rétrotransposons et les rétrovirus endogènes. À l'échelle moléculaire, elle se caractérise par des réseaux réguliers de nucléosomes, la méthylation de l'ADN et des histones et la liaison de protéines spécifiques associées à l'hétérochromatine (famille HP1). Cependant, la manière dont ces caractéristiques moléculaires conduisent à l'état condensé et définissent les propriétés fonctionnelles de l'hétérochromatine constitutive n'est pas encore claire. Le projet abordera cette question en déterminant la structure de l'hétérochromatine constitutive péricentrique directement à l'intérieur de son contenu cellulaire en utilisant la cryotomographie in situ de pointe. Les embryons de drosophile sont utilisés comme modèle expérimental, car dans leurs noyaux, les régions d'hétérochromatine péricentrique coalescent en chromocentres ronds de l'ordre du micron. Nous utilisons la cryosection avec des couteaux diamantés pour l'amincissement de l'échantillon, puis les tomogrammes des chromocentres, ainsi que d'autres domaines de la chromatine, seront enregistrés et reconstruits. Cela nous permettra de définir l'arrangement caractéristique des fibres de nucléosomes pour l'hétérochromatine péricentrique constitutive par comparaison avec l'empaquetage de la chromatine dans d'autres compartiments chromatiniens. Constitutive heterochromatin is a condensed form of chromatin, essential for the maintenance of genome stability and the defense against retrotransposons and endogenous retroviruses. At the molecular scale, it is characterized by regular nucleosome arrays, DNA and histone methylation and binding of specific heterochromatin-associated proteins (HP1 family). However, it remains unclear how these molecular features lead to the condensed state and define the functional properties of constitutive heterochromatin. The project will address this question by determining the structure of pericentric constitutive heterochromatin directly within its cellular content by using state-of-the-art in situ cryo-electron tomography. Drosophila embryos are used as the experimental model, because in their nuclei, the pericentric heterochromatin regions coalesce into round micron-scale chromocenters. We use cryo-sectioning with diamond knives for sample thinning, and then tomograms of chromocenters, as well as other chromatin domains will be recorded and reconstructed. This will enable us to define the characteristic nucleosome fiber arrangement for the constitutive pericentric heterochromatin by comparison with the chromatin packing in other chromatin compartments. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 6397481 Université de Strasbourg Strasbourg 2024-12-31 application/pdf 7231215 https://publication-theses.unistra.fr/restreint/theses_doctorat/2024/Fatmaoui_Fadwa_2024_ED414.pdf http://www.theses.fr/2024STRAJ018/abes Fatmaoui Fadwa 1995-12-17 FR 280181817 0EFB1P014C8 21410873 4200047 https://theses.fr/2024STRAJ018 2024STRAJ018 https://doi.org/10.70675/a2a524dazc8c9z45f1z833cz690150de4d54 2024-04-12 Biophysique et biologie structurale Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Eltsov Mikhail MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 264612922 Cardoso Cristina MADS_PRESIDENT_DU_JURY 280218923 Sexton Thomas MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 227420705 227420705 Gutsche Irina MADS_RAPPORTEUR_1 194301680 Heun Patrick MADS_RAPPORTEUR_2 280218990 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 155263749 93800 ddc:570 Eltsov Mikhail Cardoso Cristina Sexton Thomas Gutsche Irina Heun Patrick École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) PDF 6397481 confidentialité 2024-04-12 2025-04-12 confidentialité 2024-04-12 2025-04-12 restriction 2024-04-12 2026-04-12 restriction 2024-04-12 2026-04-12 confidentialité 2024-04-12 2025-04-12