Note ABES Crosstalk between SWI/SNF complex and transcription factors in rare kidney cancers Interaction entre les facteurs de transcription et le complexe SWI/SNF dans les cancers rare de rein Carcinome rénal SWI/SNF OCT4 Protéines de fusion Létalité synthétique Renal cell carcinoma SWI/SNF OCT4 Fusion proteins Synthetic lethality 616.99 Carcinome rénal à cellules claires Génétique Assemblage et désassemblage de la chromatine Apoptose Ce travail se concentre sur les cancers du rein rares et agressifs, en particulier ceux qui impliquent des altérations du complexe de remodelage de la chromatine ou des protéines de fusion. Le projet principal porte sur le carcinome médullaire rénal (CMR). Le CMR est un carcinome rénal rare caractérisé par la perte de SMARCB1, une sous-unité du complexe de remodelage de la chromatine SWI/SNF. Nous avons caractérisé comme cellule d'origine probable les cellules de la branche ascendante épaisse (TAL) en utilisant le séquençage de cellules uniques d'échantillons de patients. Nous avons montré qu'un changement transcriptionnel se produit entre le programme épithélial des cellules du TAL et un programme oncogénique piloté par MYC. Nous avons identifié une résistance à la ferroptose dans les cellules du CMR, ce qui en fait une cible thérapeutique possible. En outre, nous avons examiné le rôle de BRD9 dans les CMR. BRD9 est une sous-unité du complexe SWI/SNF et une létalité synthétique par rapport à d'autres tumeurs déficientes en SMARCB1. Nous avons également étudié le rôle oncogène des fusions SS18-OCT4, en constatant que leur expression est associée à l'augmentation des voies cibles de MYC. This work focuses on rare, aggressive kidney cancers, especially those involving chromatin remodeling complex alterations or fusion proteins. The primary project investigated renal medullary carcinoma (RMC). RMC is a rare renal cell carcinoma characterized by SMARCB1 loss, a subunit of the SWI/SNF chromatin remodeler complex. We characterized as the likely cell of origin cells of the thick ascending limb (TAL) utilizing single cell sequencing of patient samples. We showed that a transcriptional switch happens from TAL cells epithelial program to a MYC driven oncogenic program. We identified a ferroptosis resistance in RMC cells, making this a possible therapeutic target. Furthermore, we examined the role of BRD9 in RMC. BRD9 is a subunit of the SWI/SNF complex and a synthetic lethality to other SMARCB1-deficient tumors. We also investigated the oncogenic role of SS18-OCT4 fusions, finding that its expression is associated with upregulation of MYC target pathways. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 40526995 application/pdf 50340729 http://www.theses.fr/2024STRAJ051/document http://www.theses.fr/2024STRAJ051/abes Tawanaie Pour Sedehi Nassim 1988-05-13 FR 28263052X 223023062BH 22220219 4200010 https://theses.fr/2024STRAJ051 2024STRAJ051 https://doi.org/10.70675/9a408617z3ef4z4fa1zb6b5z9d584d308dae 2024-11-28 Sciences de la vie et de la santé Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Malouf Gabriel MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 176725563 Metzger Daniel MADS_PRESIDENT_DU_JURY 086804901 Bergamin Elisa MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 263181243 Rioux-Leclercq Nathalie MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 085026921 Frew Ian MADS_RAPPORTEUR_1 275131335 Négrier Sylvie MADS_RAPPORTEUR_2 112277187 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 155263749 93800 ddc:610 Malouf Gabriel Metzger Daniel Bergamin Elisa Rioux-Leclercq Nathalie Frew Ian Négrier Sylvie École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) PDF 40526995 confidentialité 2024-11-28 2027-11-30 confidentialité 2024-11-28 2027-11-30 restriction 2024-11-28 2027-11-30 confidentialité 2024-11-28 2027-11-30 confidentialité 2024-11-28 2027-11-30