Impact du réassortiment génétique sur la structure des ARN des virus Influenza A
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
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Auteur : Paul Stansilaus, Rithu
Date de soutenance : 06-09-2024

Directeur(s) de thèse : Marquet, Roland - Despons, Laurence

Président : Gilmer, David
Rapporteur(s) : Graf, Laura - Crépin, Thibaut
Membre(s) du jury : Isel, Catherine

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé

Mots-clés libres : Grippe, ARN, SHAPE-MaP, Intact, Désassemblé, Structures, Prédictions
Mots-clés :
  • Influenzavirus A - Génétique
  • Génomique
  • Virus à ARN
Résumé : Les virus de la grippe A (IAV) sont connus pour leurs épidémies annuelles et leurs pandémies occasionnelles. Le génome segmenté de l’IAV facilite le réassortiment génétique, permettant aux virus d’échanger des segments entiers lors de la co-infection avec des souches génétiquement homologues. Cela accélère l’évolution de l’IAV en générant des souches pandémiques avec de nouvelles combinaisons de segments pouvant échapper aux réponses immunitaires adaptatives existantes. Cependant, le réassortiment n’est pas aléatoire et est contraint par le mécanisme sélectif d’encapsidation du génome de l’IAV. Des signaux d’encapsidation spécifiques à chaque segment interagissent pour garantir qu’au moins une copie de chaque segment est sélectivement incorporée dans un virion. Ces interactions intersegmentaires influencent la fréquence de réassortiment. En étudiant les mécanismes moléculaires de ce processus, nous espérons développer des cibles potentielles pour la recherche antivirale. Nous avons généré quatre virus par génétique inverse 7:1 - H1N1/PR8, H3N2/MO et 2 réassortants à segment unique R1 (PR8_PB2MO) et R6 (PR8_NAMO). La méthodologie SHAPE-MaP a été utilisée pour déterminer les structures secondaires de l’ARN de ces virus dans deux états différents - intacts et désassemblés. Nous avons utilisé vRNAsite pour générer des prédictions d’appariements entre tous les segments des virus. Nous avons couplé nos données de SHAPE-MaP avec les prédictions informatiques de chaque virus pour identifier des régions avec des implications potentielles pour l’encapsidation du génome et le réassortiment génétique de l’IAV.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2024STRAJ100
Type de ressource : Thèse