Auto-assemblage supramoléculaire de petits peptides de type Fmoc-A-SS-B et MA-hR10 en solution : Étude par des simulations de dynamique moléculaire classique
Langue Anglais
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Modalités de diffusion de la thèse :
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Auteur : Dorosh, Tetiana
Date de soutenance : 28-06-2025

Directeur(s) de thèse : Schurhammer, Rachel - Chaumont, Alain

Président : Baud, Stéphanie
Rapporteur(s) : Baud, Stéphanie - Fitremann, Juliette

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Chimie de la matière complexe (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie informatique et théorique
Classification : Chimie, minéralogie, cristallographie

Mots-clés libres : Fmoc-A-SS-B, Auto-assemblage, Dissociation, Chiralité, Interactions protéiques, BSA, AP, MA-hR, Peptides méthacrylates, Agrégation, Concentration, Température, Contre-ions
Mots-clés :
  • Chimie -- Informatique
  • Autoassemblage
  • Dissociation (chimie)
  • Chiralité (physique)
  • Méthacrylates
  • Température
  • Peptides
Résumé : Nous avons étudié des systèmes aqueux à base de peptides par simulations de dynamique moléculaire. Dans une première partie nous avons examiné l'impact de la concentration et de la dissociation en Fmoc-A-SH et HS-B sur l’interaction entre peptides Fmoc-A-SS-B. Nous avons montré que la chiralité des peptides joue un rôle important, les agrégats (D)-Fmoc-A-SS-B présentant un comportement plus dynamique que ceux des isomères (L). Les interactions avec des protéines, l'AP et la BSA, ont révélé que les (D)-peptides ont tendance à s’adsorber rapidement à la BSA via des interactions labiles, tandis que les (L)-peptides ont une cinétique plus lente mais mettant en jeu des interactions intermoléculaires plus stables. La seconde partie concerne l'auto-assemblage de peptides à base de méthacrylate (MA-hR) et révèle que la concentration affecte de manière significative l'agrégation. Les impuretés telles que R10 conduisent à des agrégats plus petits, où la longueur de la chaîne d'arginine modifie les schémas d'agrégation. Les variations de température et la présence de contre-ions jouent un rôle crucial dans la formation, la structure et la stabilité des agrégats.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2025STRAF036
Type de ressource : Thèse