Optimisation d’un système de réactivation ciblée pour un gène suppresseur de tumeur dans les cellules de cancer gastrique
Langue Français
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 04/07/2030.
  • Thèse avec 2 versions : seule la version intégrale est proposée ; sur authentification (communication intranet).
 
Auteur : Sueur, Charlène
Date de soutenance : 04-07-2025

Directeur(s) de thèse : Weber, Michaël - Mellitzer, Georg

Président : Dantzer, Françoise
Rapporteur(s) : De Smet, Charles - Miotto, Benoit
Membre(s) du jury : Cammas, Florence

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Biotechnologie et signalisation cellulaire (Strasbourg ; 2011-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Médecine et santé, Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Epigénétique, Méthylation de l’ADN, SLFN11, CRISPR-dCas9, Chromatine, Cancer gastrique
Mots-clés :
  • Estomac - Cancer - Génétique
  • Épigénétique
  • Expression génique
Résumé : L’expression du gène SLFN11 est associée à une sensibilité accrue aux agents chimiothérapeutiques génotoxiques. Pourtant, dans de nombreuses lignées tumorales, son expression est absente, ce qui limite considérablement les chances d’efficacité thérapeutique pour le traitement du patient. Dans cette thèse, j’ai exploré les mécanismes épigénétiques responsables de la répression de SLFN11, en particulier dans la lignée gastrique humaine AGS, afin de mieux comprendre les bases moléculaires de son inactivation et d’identifier des leviers pour restaurer son expression. En combinant des approches de biologie moléculaire, de profilage de méthylation de l’ADN et d’analyse de la structure de la chromatine, j’ai mis en évidence une forte hyperméthylation du promoteur de SLFN11, accompagnée d’un état chromatinien répressif caractérisé par l’accumulation du marqueur H3K27me3 et/ou la perte d’acétylation des histones, en particulier pour H3K27ac. L’utilisation d’inhibiteurs de DNMT1, seuls ou en combinaison avec des modulateurs de la chromatine comme des inhibiteurs de HDACs ou d’EZH2, a permis d’évaluer le poids relatif de ces différentes modifications dans l’inactivation transcriptionnelle du gène. En parallèle, j’ai développé un outil d’édition épigénétique ciblée basé sur CRISPR-dCas9-Suntag, en fusionnant des domaines catalytiques de déméthylation (TET1CD) et d’acétylation (CBP-HAT) pour réactiver SLFN11 de manière spécifique et contrôlée. Ces approches combinées ont permis d’induire une légère ré-expression transcriptionnelle du gène, confirmant la faisabilité d’une reprogrammation locale de l’épigénome pour lever des silences transcriptionnels pathologiques dans les cellules cancéreuses. Dans l’ensemble, ces travaux mettent en lumière la complexité de la régulation épigénétique de SLFN11 et soulignent l’intérêt d’intervenir directement sur l’architecture épigénétique pour restaurer l’expression de gènes suppresseurs de tumeur réprimés.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2025STRAJ029
Type de ressource : Thèse