Note ABES Structural insights into human SWI/SNF chromatin remodeling complexes Analyses structurales des complexes humains SWI/SNF impliqués dans le remodelage de la chromatine Chromatine SWI/SNF BCL7A BAF47 NcBAF Cancer Chromatin SWI/SNF BCL7A BAF47 NcBAF Cancer 572.8 Chromatine Cancer Génétique Nucléosomes La chromatine compacte et organise l’ADN génomique dans le noyau eucaryote, les nucléosomes modulant l’accessibilité de l’ADN et influençant l’expression génique et la réparation ADN. Les complexes de remodelage ATP-dépendants SWI/SNF repositionnent ou éjectent les nucléosomes de la fibre chromatinienne et existent chez les mammifères sous trois sous-complexes : cBAF, PBAF et ncBAF. Des mutations dans ces complexes sont retrouvées dans plus de 20 % des cancers humains et sont associées à des maladies neurodégénératives, mais le manque d’informations structurales limite le développement de thérapies anticancéreuses. Nous rapportons ici que BCL7A, sous-unité de mSWI/SNF mutée dans le lymphome diffus à grandes cellules B, se lie au patch acide du nucléosome via un motif d’ancrage, et que la mutation d’au moins une arginine perturbe cette interaction. Cette zone est également occupée par la sous-unité BAF47 dans cBAF et PBAF, mais BAF47 est absente dans ncBAF. Nous avons donc également entrepris des études structurales du complexe ncBAF lié au nucléosome pour élucider son mécanisme de remodelage en l’absence de BAF47 et le rôle de BCL7A dans ce contexte. Chromatin compacts and organizes genomic DNA within the eukaryotic nucleus, with nucleosomes shaping DNA accessibility and influencing gene expression and DNA repair. ATP-dependent SWI/SNF remodeling complexes reposition or evict nucleosomes on chromatin fiber, and in mammals exist as cBAF, PBAF, and ncBAF. Mutations in these complexes occur in over 20% of human cancers and are linked to neurodegenerative diseases. Despite its potential as a target for anticancer therapies, drug development is limited by a lack of structural information. Here, we report that BCL7A, a mSWI/SNF subunit mutated in diffuse large B-cell lymphoma, binds the nucleosome acidic patch via an arginine anchor motif, and that mutation of at least one arginine disrupts binding. This patch is also contacted by BAF47 subunit in cBAF and PBAF, but BAF47 is absent in ncBAF. So, here, we also initiated structural studies of nucleosome-bound ncBAF complex to investigate its remodeling mechanism in the absence of BAF47 and the role of BCL7A in this context. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 20314301 http://www.theses.fr/2025STRAJ102/document http://www.theses.fr/2025STRAJ102/abes Lafouge Julie 1998-12-11 FR 29370516X 1209016245T 21900178 4200047 https://theses.fr/2025STRAJ102 2025STRAJ102 https://doi.org/10.70675/7ba6c59az383az4b3ezbb28z3821549ea67b 2025-12-05 Biophysique et biologie structurale Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Bergamin Elisa MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 263181243 Davidson Irwin MADS_PRESIDENT_DU_JURY 075977249 Carles Christel MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 203950615 Gutsche Irina MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 194301680 Gérard Matthieu MADS_RAPPORTEUR_1 10936581X Tisné Carine MADS_RAPPORTEUR_2 131351834 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 155263749 93800 ddc:570 Bergamin Elisa Davidson Irwin Carles Christel Gutsche Irina Gérard Matthieu Tisné Carine École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) PDF 20314301 confidentialité 2025-12-05 2029-12-05 confidentialité 2025-12-05 2029-12-05 confidentialité 2025-12-05 2029-12-05 confidentialité 2025-12-05 2029-12-05