Déterminisme génétique et potentiel de prédiction dans les populations du programme INRAE-ResDur pour la création de variétés de vignes résistantes aux maladies
Genetic determinism and predictive potential in populations of the INRAE-ResDur breeding program for developing disease-resistant grapevine varieties
Vigne
Déterminisme génétique
Sélection
Sélection multi-omique
Grapevine
Genetic determinism
Breeding
Multi-omic prediction
581.3
Vigne
Résistance aux maladies
Sélection artificielle
Génétique végétale
La viticulture française fait face aujourd’hui à plusieurs défis majeurs dont deux principaux : l'adaptation au changement climatique et la réduction des produits phytosanitaires. La création de variétés résistantes aux maladies représente une solution prometteuse, illustrée par le programme INRAE-ResDur, mais le cycle de sélection de 15 ans minimum freine leur développement et diffusion. Les caractères déterminant les idéotypes variétaux présentent une architecture génétique complexe, rendant la sélection assistée par marqueurs peu efficace. Cette thèse a exploité les populations ResDur pour identifier les bases génétiques de caractères agronomiques (QTL, GWAS), et évaluer des modèles de prédiction génomique, phénomique (NIRS) et métabolomique (LC-MS). Les résultats démontrent la faisabilité et la complémentarité des approches omiques en viticulture, et conduisent à un nouveau schéma de sélection combinant ces approches pour réduire le cycle de 15 à 9-10 ans, accroître le gain génétique et accélérer l'intégration de nouvelles résistances.
French viticulture today faces several major challenges, two of which are paramount : adaptation to climate change and reduction of plant protection products. The development of disease-resistant varieties represents a promising solution, as illustrated by the INRAE-ResDur program, but the minimum 15-year selection cycle hinders their development and adoption. The traits determining varietal ideotypes exhibit a complex genetic architecture, making marker-assisted selection largely ineffective. This thesis exploited ResDur populations to identify the genetic bases of agronomic traits (QTL, GWAS), and to evaluate genomic, phenomic (NIRS) and metabolomic (LC-MS) prediction models. The results demonstrate the feasibility and complementarity of omics-based approaches in viticulture, and lead to a new selection scheme combining these approaches to reduce the cycle from 15 to 9–10 years, increase genetic gain per unit of time, and accelerate the integration of new sources of resistance.
Electronic Thesis or Dissertation
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fr
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Borrelli
Clémentine
1999-04-29
FR
297284045
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2025STRAJ136
https://doi.org/10.70675/cd702e0bzf23az41dfz800fzc558ff2671aa
2025-12-08
Sciences agronomiques
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Santé de la vigne et qualité du vin (Strasbourg)
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