Note ABES Epitranscriptomic modifications and viral infection mechanisms in Drosophila melanogaster Modifications épitranscriptomiques et mécanismes d'infection virale chez Drosophila melanogaster Modification de l'ARN M5C Arthropode Immunité innée Epitranscriptomique RNA modification M5C Arthropod Innate immunity Epitranscriptomic 579.2 572.8 Virus à ARN ARN -- Modifications posttranscriptionnelles Drosophila melanogaster Relations hôte-virus À ce jour, plus de 170 modifications distinctes de l'ARN ont été identifiées, avec des fonctions biologiques allant de la régulation de l'expression génique à la défense antivirale. Bien que ces modifications aient été largement caractérisées dans les ARN non codants, où elles influencent à la fois la structure et la fonction de l'ARN, les ARN viraux n'ont que récemment fait l'objet d'investigations intensives visant à cartographier précisément leur paysage épitranscriptomique et à élucider leurs rôles au cours de l'infection. Au cours de cette thèse, j'ai identifié des 2'-O-méthylations et des 5-méthylcytosines sur l'ARN génomique du virus Flock House. Grâce à des approches de knockdown et de knockout ciblant des enzymes candidates, NSUN2 a été identifiée comme la méthyltransférase responsable du dépôt de modifications m5C à trois sites discrets sur le génome de FHV. Dans les cellules S2 de Drosophile, la perte de m5C dépendante de NSUN2 sur le génome de FHV a entraîné une altération de la réplication virale. Ce travail représente la première cartographie à résolution nucléotidique de m5C sur un génome viral dans un système d'insectes, comblant une lacune dans notre compréhension des interactions épitranscriptomiques hôte-virus dans les modèles non-mammifères. To date, over 170 distinct RNA modifications have been identified, with biological functions ranging from regulation of gene expression to antiviral defense. While these modifications have been extensively characterized in non-coding RNAs, where they influence both RNA structure and function, viral RNAs have only recently become subject to intensive investigation to precisely map their epitranscriptomic landscape and elucidate their roles during infection. During this thesis, I identified 2’-O-methylations and 5-methylcytosines on the genomic RNA of Flock House virus. Through knockdown and knockout approaches targeting candidate enzymes, NSUN2 was identified as the methyltransferase responsible for depositing m5C modifications at three discrete sites on the FHV genome. In Drosophila S2 cells, loss of NSUN2-dependent m5C on FHV’s genome resulted in impaired viral replication. This work represents the first nucleotide-resolution mapping of m5C on a viral genome in an insect system, filling a knowledge gap in our understanding of hostvirus epitranscriptomic interactions in non-mammalian models. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 11383446 application/pdf 14011149 http://www.theses.fr/2026STRAJ007/document https://theses.fr/2026STRAJ007/abes Morand Thomas 1996-07-20 FR 297880853 1707005112P 22013226 4200047 https://theses.fr/2026STRAJ007 2026STRAJ007 https://doi.org/10.70675/3e66ea00z9a24z433dz9b8cz467af4333af9 2026-04-02 Biologie cellulaire et moléculaire Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Meignin Carine MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 238184706 Blevins Todd MADS_PRESIDENT_DU_JURY 236110039 Isel Catherine MADS_RAPPORTEUR_1 149151446 Roignant Jean-Yves MADS_RAPPORTEUR_2 089048261 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Modèles Insectes de l'Immunité Innée (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 157771342 561325 ddc:570 Meignin Carine Blevins Todd Isel Catherine Roignant Jean-Yves École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Modèles Insectes de l'Immunité Innée (Strasbourg) PDF 11383446 confidentialité 2026-04-02 2027-04-02 confidentialité 2026-04-02 2027-04-02 confidentialité 2026-04-02 2027-04-02 confidentialité 2026-04-02 2027-04-02