Évaluation de la métabolomique pour les carcinomes rénaux à cellules claires à partir d’une étude rétrospective de 109 cas. Étude rétrospective évaluant l’apport de la métabolomique par RMN-HRMAS pour la recherche de biomarqueurs...
Langue Français
Langue Français
Auteur(s) : Werle Pierre
Directeur : Tricard Thibault
Composante : MEDECINE
Date de création : 16-09-2020
Description : Médecine. Chirurgie générale, Introduction : la classification pronostique actuelle des carcinomes rénaux repose sur des fac-teurs anatomopathologiques, cliniques et biologiques ainsi que sur des systèmes pronostiques. La métabolomique est une discipline récente, permettant la détection systématique et exhaustive ainsi que la quantification des métabolites, molécules produites lors des étapes du métabolisme. Dans le domaine de l’oncologie, les données de la littérature montrent un intérêt de la métabo-lomique comme outil pour la recherche de biomarqueurs diagnostiques, pronostiques et de la réponse au traitement des cancers. L’objectif de cette étude était d’évaluer la métabolomique pour la recherche de biomarqueurs pronostiques des carcinomes rénaux à cellules claires. Matériel - méthode : les patients ayant été opérés d’une néphrectomie aux hôpitaux universitaires de Strasbourg entre 2005 et 2009 pour carcinome rénal à cellules claires et pour lesquels une analyse métabolomique tissulaire par RMN-HRMAS avait été effectuée étaient inclus rétrospectivement. Des groupes expérimentaux étaient définis à partir des données anatomopathologiques et des données de survie. L’algorithme ADEMA était utilisé afin de rechercher des modifications des voies métaboliques entre les groupes expérimentaux. Résultats : cent neufs patients étaient inclus pour 110 carci-nomes rénaux à cellules claires. Dix-sept métabolites étaient identifiés par RMN-HRMAS. Des modifications significatives des voies métaboliques étaient uniquement retrouvées dans la sous population de patients métastatiques, lorsque les groupes expérimentaux étaient définis selon les données de survie : - 12 mois et - 120 mois. Ces modifications concernaient le métabolisme énergétique : accélération de la glycolyse au détriment de la voie du cycle de Krebs et de la voie alternative du glutamate. L’analyse multivariée de l’ensemble de la population retrouvait 4 mé-tabolites susceptible d’être d’intérêt pronostique pour la survie sans progression : l’aspartate (HR =5,66) la choline (HR = 0,00056), la Glycérophosphocholine (HR = 0,18) et la créatine (HR = 3,81). Deux métabolites étaient identifiés comme d’intérêt pronostique pour la survie globale : taurine (HR = 1,23) et la phosphocholine (HR = 1,1). Cependant, ces résultats sont à prendre avec une grande prudence compte tenu des limites méthodologiques de cette série : caractère rétrospectif, biais lié à la sélection des patients, absence de données concernant les critères de qualité des échantillons. Conclusion : notre série présente de trop nombreuses limites pour conclure à un apport de la mé-tabolomique pour la recherche de facteurs pronostiques des carcinomes rénaux à cellules claires. Cependant, un intérêt pourrait exister dans la sous population de patients métastatiques, ce qui pourrait conduire à la réalisation d’une nouvelle étude à la méthodologie rigoureuse incluant uni-quement des patients de cette sous population., Introduction: The current prognostic classification of renal carcinomas is based on anatomopathological, clinical and biological factors as well as on prognostic systems. Metabolomics is a recent discipline, allowing the systematic and exhaustive detection as well as the quantification of metabolites, molecules produced during the stages of metabolism. In the field of oncology, the data in the literature show an interest in metabolomics as a tool for the search for diagnostic, prognostic and response biomarkers to cancer treatment. The objective of this study was to evaluate metabolomics for the search for prognostic biomarkers of renal clear cell carcinoma. Material - method: Patients who underwent nephrectomy at Strasbourg university hospitals between 2005 and 2009 for clear cell renal carcinoma and for whom a tissue metabolomic analysis by HRMAS NMR had been performed were included retrospectively. Experimental groups were defined on anatomopathological data and survival data. The ADEMA algorithm was used to search for changes in metabolic pathways between experimental groups. Results: One hundred and nine patients were included for 110 clear cell renal carcinomas. Seventeen metabolites were identified by HRMAS NMR. Significant changes in metabolic pathways were only found in the subpopulation of metastatic patients, when the experimental groups were defined according to survival data: -12 months and- 120 months. These modifications concerned energy metabolism: acceleration of glycolysis to the detriment of the Krebs cycle pathway and the alternative glutamate pathway. Multiva-riate analysis of the entire population found 4 metabolites likely to be of prognostic interest for progressionf free survival: aspartate (HR = 5.66) choline (HR = 0.00056), Glycerophosphocholine (HR = 0.18) and creatine (HR = 3.81). Two metabolites were identified as of prognostic interest for overall survival: taurine (HR = 1.23) and phosphocholine (HR = 1.1). However, these results should be taken with great caution given the methodological limitations of this series: retrospective nature, bias linked to patient selection, absence of data concerning the quality criteria of the samples. Conclu-sion: Our series has too many limitations to conclude that metabolomics can contribute for the search for prognostic factors in clear cell renal carcinomas. However, an interest could exist in the subpopulation of metastatic patients, which could lead to the performance of a new study with rigorous methodology including only patients from this subpopulation.
Mots-clés libres : Métabolomique, 617.6, Carcinome rénal à cellules claires
Couverture : FR
Directeur : Tricard Thibault
Composante : MEDECINE
Date de création : 16-09-2020
Description : Médecine. Chirurgie générale, Introduction : la classification pronostique actuelle des carcinomes rénaux repose sur des fac-teurs anatomopathologiques, cliniques et biologiques ainsi que sur des systèmes pronostiques. La métabolomique est une discipline récente, permettant la détection systématique et exhaustive ainsi que la quantification des métabolites, molécules produites lors des étapes du métabolisme. Dans le domaine de l’oncologie, les données de la littérature montrent un intérêt de la métabo-lomique comme outil pour la recherche de biomarqueurs diagnostiques, pronostiques et de la réponse au traitement des cancers. L’objectif de cette étude était d’évaluer la métabolomique pour la recherche de biomarqueurs pronostiques des carcinomes rénaux à cellules claires. Matériel - méthode : les patients ayant été opérés d’une néphrectomie aux hôpitaux universitaires de Strasbourg entre 2005 et 2009 pour carcinome rénal à cellules claires et pour lesquels une analyse métabolomique tissulaire par RMN-HRMAS avait été effectuée étaient inclus rétrospectivement. Des groupes expérimentaux étaient définis à partir des données anatomopathologiques et des données de survie. L’algorithme ADEMA était utilisé afin de rechercher des modifications des voies métaboliques entre les groupes expérimentaux. Résultats : cent neufs patients étaient inclus pour 110 carci-nomes rénaux à cellules claires. Dix-sept métabolites étaient identifiés par RMN-HRMAS. Des modifications significatives des voies métaboliques étaient uniquement retrouvées dans la sous population de patients métastatiques, lorsque les groupes expérimentaux étaient définis selon les données de survie : - 12 mois et - 120 mois. Ces modifications concernaient le métabolisme énergétique : accélération de la glycolyse au détriment de la voie du cycle de Krebs et de la voie alternative du glutamate. L’analyse multivariée de l’ensemble de la population retrouvait 4 mé-tabolites susceptible d’être d’intérêt pronostique pour la survie sans progression : l’aspartate (HR =5,66) la choline (HR = 0,00056), la Glycérophosphocholine (HR = 0,18) et la créatine (HR = 3,81). Deux métabolites étaient identifiés comme d’intérêt pronostique pour la survie globale : taurine (HR = 1,23) et la phosphocholine (HR = 1,1). Cependant, ces résultats sont à prendre avec une grande prudence compte tenu des limites méthodologiques de cette série : caractère rétrospectif, biais lié à la sélection des patients, absence de données concernant les critères de qualité des échantillons. Conclusion : notre série présente de trop nombreuses limites pour conclure à un apport de la mé-tabolomique pour la recherche de facteurs pronostiques des carcinomes rénaux à cellules claires. Cependant, un intérêt pourrait exister dans la sous population de patients métastatiques, ce qui pourrait conduire à la réalisation d’une nouvelle étude à la méthodologie rigoureuse incluant uni-quement des patients de cette sous population., Introduction: The current prognostic classification of renal carcinomas is based on anatomopathological, clinical and biological factors as well as on prognostic systems. Metabolomics is a recent discipline, allowing the systematic and exhaustive detection as well as the quantification of metabolites, molecules produced during the stages of metabolism. In the field of oncology, the data in the literature show an interest in metabolomics as a tool for the search for diagnostic, prognostic and response biomarkers to cancer treatment. The objective of this study was to evaluate metabolomics for the search for prognostic biomarkers of renal clear cell carcinoma. Material - method: Patients who underwent nephrectomy at Strasbourg university hospitals between 2005 and 2009 for clear cell renal carcinoma and for whom a tissue metabolomic analysis by HRMAS NMR had been performed were included retrospectively. Experimental groups were defined on anatomopathological data and survival data. The ADEMA algorithm was used to search for changes in metabolic pathways between experimental groups. Results: One hundred and nine patients were included for 110 clear cell renal carcinomas. Seventeen metabolites were identified by HRMAS NMR. Significant changes in metabolic pathways were only found in the subpopulation of metastatic patients, when the experimental groups were defined according to survival data: -12 months and- 120 months. These modifications concerned energy metabolism: acceleration of glycolysis to the detriment of the Krebs cycle pathway and the alternative glutamate pathway. Multiva-riate analysis of the entire population found 4 metabolites likely to be of prognostic interest for progressionf free survival: aspartate (HR = 5.66) choline (HR = 0.00056), Glycerophosphocholine (HR = 0.18) and creatine (HR = 3.81). Two metabolites were identified as of prognostic interest for overall survival: taurine (HR = 1.23) and phosphocholine (HR = 1.1). However, these results should be taken with great caution given the methodological limitations of this series: retrospective nature, bias linked to patient selection, absence of data concerning the quality criteria of the samples. Conclu-sion: Our series has too many limitations to conclude that metabolomics can contribute for the search for prognostic factors in clear cell renal carcinomas. However, an interest could exist in the subpopulation of metastatic patients, which could lead to the performance of a new study with rigorous methodology including only patients from this subpopulation.
Mots-clés libres : Métabolomique, 617.6, Carcinome rénal à cellules claires
Couverture : FR
Type : Thèse d’exercice, ressource électronique, Médecine
Format : Document PDF
Source(s) :
Format : Document PDF
Source(s) :
- http://www.sudoc.fr/249287781
Entrepôt d'origine :
Identifiant : ecrin-ori-102562
Type de ressource : Ressource documentaire
![Ressource locale](https://ecrin.app.unistra.fr/search/media/repositories/workflow.png)
Identifiant : ecrin-ori-102562
Type de ressource : Ressource documentaire