Duplications dans le génome de Saccharomyces cerevisiae : sélections, caractérisation et mécanismes
Langue Français
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Auteur : Schacherer, Joseph
Date de soutenance : 01-01-2005
Directeur(s) de thèse : Potier, Serge
Établissement de soutenance : Université Louis Pasteur (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Mots-clés libres : Saccharomyces cerevisiae , remaniements chromosomiques , duplications , rétroposition , aneuploïdie
Mots-clés :
- Saccharomyces cerevisiae
- Thèses et écrits académiques
- Génome
- Thèses et écrits académiques
- ADN
- Thèses et écrits académiques
- Aneuploïdie
- Thèses et écrits académiques
Résumé : La duplication des séquences d'ADN contribue à la plasticité des génomes et représente un des moteurs de l'évolution. Ces dernières années, le séquençage systématique de plusieurs organismes montre l'importance quantitative des régions dupliquées au sein des génomes. Cependant, l'analyse de ces séquences n'a pas permis d'élucider les mécanismes impliqués dans la genèse de tels événements.Au laboratoire, un système expérimental basé sur l'uti li sa tion de l'al lè le mutant du gène URA2 a permis de sélectionner positivement des duplications d'ADN chez S. ce re vi siae. Afin de caractériser les duplications et de comprendre les mécanismes impliqués, une analyse moléculaire fine de 2 collections de révertants (haploïdes et diploïdes) porteurs d'une duplication a été réalisée.L'analyse des révertants haploïdes a permis de mettre en évidence deux processus par lesquels une séquence d'ADN peut se du pli quer : la du pli ca tion gé ni que et la duplication seg men ta le. Les duplications géniques sont is sues d'un pro ces sus de ré tro po si tion c'est-à-di re de la for ma tion d'un ADNc suite à la trans crip tion inverse de l'ARNm cor res pon dant sui vie de son in té gra tion dans le gé no me. Les duplications segmentales sont des régions dupliquées en tan dem di rect de taille comprise entre 5 et 90 kb. Le mé ca nis me impliqué dans leur formation correspond probablement à une er reur lors de la ré pli ca tion.L'analyse des révertants diploïdes a permis de mettre en évi den ce deux autres moyens par lesquels une séquence d'ADN peut se du pli quer : l'aneu ploï die et la trans lo ca tion non-ré ci pro que. Ces deux ty pes de re ma nie ments conduisent à la formation d'un chromosome chimère obtenu probablement par un mécanisme de ty pe BIR (break-in du ced re pli ca tion).Cette étude apporte une preuve expérimentale sur la pluralité des moyens et des mécanismes permettant à une même séquence de se dupliquer. De plus, elle souligne l'importance de la ploïdie dans la sélection de tels remaniements.
Entrepôt d'origine : 
Identifiant : ecrin-ori-287473
Type de ressource : Thèse
