Sélection et analyse de remaniements chromosomiques chez Saccharomyces cerevisiae en contexte diploïde : origine des délétions et des translocations réciproques
Langue Français
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Auteur : Tourrette, Yves
Date de soutenance : 01-01-2004

Directeur(s) de thèse : Souciet, Jean-Luc


Établissement de soutenance : Université Louis Pasteur (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Saccharomyces cerevisiae , remaniements chromosomiques , diploïde , délétion , translocation réciproque
Mots-clés :
  • Saccharomyces cerevisiae - Thèses et écrits académiques
  • Translocation (génétique) - Thèses et écrits académiques
  • Chromosomes - Thèses et écrits académiques
  • Délétion chromosomique - Thèses et écrits académiques
Résumé : Les réarrangements chromosomiques de type translocation, délétion et duplication de séquences sont un moteur essentiel de l'évolution des génomes eucaryotes, mais sont également impliqués dans le phénomène d'oncogenèse chez les eucaryotes supérieurs pluricellulaires. Pour les étudier, nous utilisons un crible de sélection positive en contexte diploïde chez un organisme modèle, la levure hémiascomycète Saccharomyces cerevisiae . Nous avons isolé 39 révertants diploïdes dont certains contiennent des duplications intra ou interchromosomiques ou bien des délétions, événements déjà observés en phase haploïde. Nous avons également isolé d'autres réarrangements spécifiques du contexte diploïde : une délétion segmentale de 128,3 kb, une délétion homozygote, une translocation réciproque et une délétiontranslocation réciproque. L'analyse génétique a montré que 15 événements provoquent un caractère létal à l'état haploïde. En phase diploïde nous pouvons donc observer des événements variés et complexes dont certains sont impossibles à observer en phase haploïde. L'analyse des jonctions des délétions a permis de caractériser trois classes en fonction des séquences en répétition directe (microhomologies) qui se trouvaient aux bornes de la région délétée : la classe I présente des microhomologies de 8 à 13 bp, la classe II ne possède aucune séquence de ce type et la classe III, spécifique du contexte diploïde, montre des microhomologies de 1 à 4 bp. Les mêmes types de séquences sont trouvées aux jonctions des translocations réciproques. Ces résultats suggèrent un mécanisme de recombinaison entre courtes séquences en répétition directe dans la genèse des délétions et des translocations réciproques. Nous avons ensuite étudié l'implication du NHEJ et de la recombinaison homologue dans l'apparition de ces événements. Ceci nous a conduit à l'hypothèse d'un mécanisme, RAD52 - indépendant, mais dépendant de la voie de la recombinaison homologue pour les délétions de classe I.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-287653
Type de ressource : Thèse