Interaction hôte / pathogène : étude du modèle Humulus lupulus
Langue Français
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Auteur : Hatsch, Didier
Date de soutenance : 01-01-2004
Directeur(s) de thèse : Jeltsch, Jean-Marc
Établissement de soutenance : Université Louis Pasteur (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Plantes. Botanique
Mots-clés libres : Houblon
Mots-clés :
- Houblon
- Thèses et écrits académiques
- Fusarium
- Thèses et écrits académiques
- Topoisomérase II
- Thèses et écrits académiques
- Facteurs de transcription
- Thèses et écrits académiques
Résumé : Fusarium graminearum est un agent pathogène de première importance pour les cultures céréalières. Cette espèce n'est pas répertoriée comme pathogène du houblon (Humulus lupulus L.), cependant elle a été retrouvée en Alsace sur cette plante lors d'épisodes de dépérissement. Une technique d'identification des espèces du genre Fusarium basée sur la cellobiohydrolase-C associant une méthode CAPS (Cleaved Amplified Polymorphic Sequence) et une analyse par western blot a été mise au point. Elle permet d'identifier rapidement et à moindre coût 11 espèces de Fusarium. Dans le but d'améliorer la fiabilité de l'identification nous avons retenu un autre marqueur moléculaire : la topoisomérase II. Ces deux nouveaux marqueurs ont été validés et se montrent plus pertinents dans la détermination des espèces du genre Fusarium que l'ADNr. Une approche de génomique a permis de prédire et de valider 22 gènes codant putativement pour des xylanases. Lors d'une approche transcriptomique quantitative, l'expression des différents gènes a permis de mettre en évidence l'implication majoritaire de 4 xylanases dans la dégradation de parois végétales. La construction et le criblage aléatoire d'une banque suppressive soustractive a mis en évidence de nombreuses CWDE (Cell Wall Degrading Enzymes) et confirmé l'implication des xylanases majoritaires dans la dégradation des parois végétales. De plus des gènes candidats potentiellement impliqués dans la pathologie ont également été révélés. Ce travail est une première exploration du couple Humulus lupulus / Fusarium graminearum comme modèle d'étude. L'apport des marqueurs moléculaires permet d'entamer une nouvelle approche des populations de Fusarium sur des plants de houblon. L'identification de CWDE étant activées lors du processus infectieux permet d'engager la recherche d'inhibiteurs de ces enzymes, afin de comprendre et de contrôler la pathologie.
Entrepôt d'origine : 
Identifiant : ecrin-ori-287713
Type de ressource : Thèse
