La rétrotranscription de HIV-1 : étude du complexe d'initiation et des mécanismes de résistance aux inhibiteurs nucléosidiques
Langue Français
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Auteur : Goldschmidt, Valérie
Date de soutenance : 01-01-2004

Directeur(s) de thèse : Marquet, Roland - Ehresmann, Bernard

Établissement de soutenance : Université Louis Pasteur (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : rétrovirus , HIV , rétrotranscription , ARNt amorce - structure , initiation , résistance , inhibiteur - Mg2+
Mots-clés :
  • VIH (virus) - Thèses et écrits académiques
  • Rétroviridés - Thèses et écrits académiques
  • ARN - Thèses et écrits académiques
  • Magnésium - Thèses et écrits académiques
Résumé : La rétrotranscription de HIV-1 permet la synthèse de l'ADN proviral bicaténaire à partir de l'ARN génomique. Elle requiert la présence de l'ARN viral (ARNv) qui sert de matrice, l'ARNt3Lys cellulaire qui sert d'amorce, et la rétrotranscriptase. L'extrémité 3 de l'ARNt3Lys est strictement complémentaire d'une séquence appelée Primer Binding Site où débute la rétrotranscription. Outre cette interaction, des remaniements conformationnels intra- et intermoléculaires ont lieu lors de la formation du complexe ARNt3Lys/ARNv de l'isolat MAL'de HIV-1. Nous avons identifié les éléments structuraux du complexe d'initiation de l'isolat MAL'de HIV-1 cruciaux pour l'initiation de la rétrotranscription. Nos résultats montrent le rôle essentiel de la structure tridimensionnelle globale dans le processus d'initiation. Puis, nous avons entrepris une étude structurale (in vitro et in situ) et fonctionnelle comparative de deux isolats, MAL'et Hxb2, dont les domaines PBS appartiennent respectivement aux sous-types A et B. Cette étude a montré la versatilité du système HIV-1. Contrairement à la situation observée avec l'isolat MAL, l'interaction entre le PBS de l'ARNv de l'isolat Hxb2 et l'extrémité 3 de l'ARNt3Lys est suffisante pour initier la rétrotranscription, en absence de tout remaniement conformationnel.Lors du traitement par l'AZT, de nombreuses mutations de résistance apparaissent. Bien que les mutations de résistance permettent une réparation par ATP-lyse, la RT sauvage présente une résistance innée via le mécanisme de pyrophosphorolyse, dont l'efficacité d'enlèvement est supérieure à celle obtenue par ATP-lyse en présence de l'enzyme résistante.La concentration en Mg2+ libre influence les activités RNase H et polymérase de la RT de HIV-1, en agissant sur l'incorporation de nt et la processivité de l'enzyme, ainsi que la stabilité de la matrice ARN. De plus, l'inhibition de la synthèse d'ADN par un terminateur de chaîne est dépendante de la concentration en Mg2+.[...]
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-287783
Type de ressource : Thèse