Etude de la diversité génétique de l'espèce Campylobacter jejuni par l'utilisation de puces à ADN
Langue Français
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Auteur : Poly, Frédéric
Date de soutenance : 01-01-2005

Directeur(s) de thèse : Meyer, Jean-Marie - Stintzi, Alain

Établissement de soutenance : Université Louis Pasteur (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Campyloabcter jejuni , pathogénicité bactérienne , Puces à ADN , genomique , Ferric Uptake Regulator
Mots-clés :
  • Campylobacter jejuni - Thèses et écrits académiques
  • Filtres à ADN - Thèses et écrits académiques
  • Fer - Thèses et écrits académiques
  • Génétique - Thèses et écrits académiques
Résumé : Cette étude a conduit à l'identification des séquences nucléotidiques uniques de deux souches non séquencées de Campylobacter jejuni, bactérie à l'origine d'affections entériques chez l'homme par comparaison avec la souche séquencée NCTC 11168. Nous avons étudié les souches C. jejuni TGH 9011 et 81-176, toutes deux présentant des phénotypes de virulence plus accentués que la souche séquencée. Nous avons mis au point une puce à ADN de type " shotgun ", générée par dépôt de plasmides représentatifs d'une banque génomique totale de chacune de ces deux souches. L'étude a permis l'identification de 130 ORFs spécifiques par rapport à la souche-type pour TGH 9011 et 86 ORFs ainsi que la séquence du plasmide pTet pour 81-176. Les gènes identifiés chez ces souches sont impliqués principalement dans des mécanismes démontrés comme étant liés à la pathogenèse de C. jejuni. La puce à ADN de TGH 9011 a également été utilisée de façon préliminaire à l'identification des gènes régulés par la proteine Fur (Ferric Uptake Regulator). Ces travaux démontrent l'efficacité de l'utilisation de puce à ADN de type " shotgun " pour l'identification de la diversité génétique bactérienne.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-288053
Type de ressource : Thèse