Cartographie haute-résolution des amplifications de la région 3q25-qter pour l'identification d'oncogènes dans différents types tumoraux,Application à des fibro-histiocytomes malins et des carcinomes épidermoïdes (poumon et voies aéro-digestives supérieur
Langue Anglais
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Auteur : Hussenet, Thomas
Date de soutenance : 01-01-2005
Directeur(s) de thèse : du Manoir, Stanislas
Établissement de soutenance : Université Louis Pasteur (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Discipline : Sciences de la vie et de la santé
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Mots-clés libres : Aberration chromosomique
Mots-clés :
- Aberration chromosomique
- Thèses et écrits académiques
- Oncogènes
- Thèses et écrits académiques
- Poumon
- Thèses et écrits académiques
- Voies aéro-digestives supérieures
- Thèses et écrits académiques
- Amplification génique
- Thèses et écrits académiques
- Hybridation génomique comparative
- Thèses et écrits académiques
Résumé : L'approche de clonage positionnel a été appliquée à la cartographie haute résolution des aberrations du chromosome 3 dans différents types tumoraux afin d'identifier de nouveaux candidats oncogènes du bras long du chromosome 3 (3q), amplifiés et sur-exprimés en conséquence.Une première partie a été dédiée aux Fibro-Histiocytomes Malins (MFH). Des amplicons chevauchants du locus 3q28 ont été caractérisés dans une lignée cellulaire et deux tumeurs de MFH. A ce locus, nous avons identifié un oncogène candidat, hsa-miR-28, codant pour un microARN ainsi que trois de ses cibles, impliquées dans la régulation du cycle cellulaire.Une seconde partie concerne les carcinomes épidermoïdes (SCC).Nous avons analysé les aberrations du chromosome 3 dans 25 SCC du poumon par hybridation génomique comparative sur puces à ADN (CGH array) et défini une région consensus de 2 Mb au locus 3q26.3 amplifiée à haut niveau dans 20% des cas. L'analyse des conséquences transcriptionnelles pour 9 gènes a montré que la plupart sont sur-exprimés de manière récurrente mais deux, SOX2 et SOX2OT, représentent vraisemblablement les cibles des amplifications du locus.Nous avons également isolé le gène cyclin L1 au locus 3q25.3 comme oncogène candidat dans les SCC des Voies Aéro-Digestives Supérieures (VADS). Le nombre de copies du gène est très fréquemment augmenté dans ces tumeurs et le gène surexprimé. Finalement, nous avons caractérisé par CGH array différentes amplifications du 3q dans une série de 25 SCC des VADS, définissant une région commune avec les SCC du poumon suggérant ainsi que des gènes similaires du locus 3q26.3 sont impliqués dans les SCC indépendamment de leur localisation.En conclusion, nous avons isolé sur le bras long du chromosome 3 différents candidats oncogènes dans plusieurs types tumoraux, ce qui illustre la puissance de l'approche de clonage positionnel appliquée aux génomes tumoraux. Des travaux sont encore nécessaires pour vérifier leur statut oncogénique.
Entrepôt d'origine : 
Identifiant : ecrin-ori-289657
Type de ressource : Thèse
