Approche systématique et intégrative pour le stockage, l'analyse et la visualisation des données d'expression génique acquises par des techniques à haut débit, dans des tissus neuronaux
Langue Anglais
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Auteur : Kalathur, Ravi Kiran Reddy
Date de soutenance : 15-01-2008

Directeur(s) de thèse : Poch, Olivier

Établissement de soutenance : Université Louis Pasteur (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Bioinformatique
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : expression de gènes , méta-analyse , distribution de Dirichlet , classification , système de gestion de base de données relationnels , SGBD-R , rétine , RETINOBASE
Mots-clés :
  • Bioinformatique - Thèses et écrits académiques
  • Rétine - Thèses et écrits académiques
  • Bases de données - Thèses et écrits académiques
  • Expression génique - Thèses et écrits académiques
  • Analyse des données - Thèses et écrits académiques
  • Transcription génétique - Thèses et écrits académiques
Résumé : Le travail présenté dans ce manuscrit concerne différents aspects de l'analyse des données d'expression de gènes, qui englobe l'utilisation de méthodes statistiques et de systèmes de stockage et de visualisation, pour exploiter et extraire des informations pertinentes à partir de grands volumes de données. Durant ma thèse j'ai eu l'opportunité de travailler sur ces différents aspects, en contribuant en premier lieu aux tests de nouvelles approches de classification et de méta-analyses à travers la conception d'applications biologiques, puis dans le développement de RETINOBASE (http://alnitak.u-strasbg.fr/RetinoBase/), une base de données relationnelle qui permet le stockage et l'interrogation performante de données de transcriptomique et qui représente la partie majeure de mon travail.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-294495
Type de ressource : Thèse