Réarrangements chromosomiques chez Saccharomyces cerevisiae : influence du contexte génétique et mécanismes impliqués dans leur apparition
Langue Français
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Auteur : Fritsch, Émilie
Date de soutenance : 09-06-2008

Directeur(s) de thèse : Potier, Serge - de Montigny, Jacky

Établissement de soutenance : Université Louis Pasteur (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : saccharomyces cerevisiae , remaniements chromosomiques , variabilité intra-espèce , transposition , évolution des génomes
Mots-clés :
  • Microorganismes - Thèses et écrits académiques
  • Saccharomyces cerevisiae - Thèses et écrits académiques
  • Translocation (génétique) - Thèses et écrits académiques
Résumé : Les remaniements chromosomiques tels que les délétions, les duplications ou les insertions de rétrotransposons Ty1 représentent des événements moteurs dans l'évolution. Ils sont à l'origine de la variabilité inter- et intra-espèces. Cependant, l'influence des variations intra-espèces ainsi que les mécanismes à l'origine de la formation des remaniements chromosomiques sont encore peu connus. Au laboratoire, un crible génétique basé sur un allèle particulier du gène URA2 a été développé permettant ainsi de sélectionner des révertants porteurs de remaniements chromosomiques spontanés chez la levure S. cerevisiae. Afin d'appréhender l'impact du contexte génétique sur l'apparition des remaniements chromosomiques, nous avons comparé deux souches de S. cerevisiae utilisées en laboratoire à savoir la souche FL100 et la souche de référence séquencée S288c. On a ainsi pu montrer que la variabilité intra-espèces a une influence sur les types de remaniements obtenus et que cette variation est due à une différence d'activité des rétrotransposons Ty1. L'étude des mécanismes permettant l'apparition des réarrangements a également été réalisée. Des souches de levure ont été construites portant des mutations dans des gènes dont les produits sont impliqués dans la voie de recombinaison homologue (RAD52 et RAD59) et dans celle du non-homologous end joining (NHEJ) (YKU80 et LIG4). Les résultats obtenus suggèrent qu un mécanisme de NHEJ indépendant de la protéine Yku80p est impliqué dans l'apparition des délétions et des duplications. Enfin, nous avons appréhendé la variabilité inter-espèces et l'évolution des génomes par l'étude in silico de deux familles multigéniques codant pour des perméases.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-295015
Type de ressource : Thèse