Polyadenylation and RNA degradation : from mitochondria to the nucleus of Arabidopsis thaliana
Langue Anglais
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Auteur : Holec, Sarah
Date de soutenance : 07-03-2008

Directeur(s) de thèse : Gagliardi, Dominique

Établissement de soutenance : Université Louis Pasteur (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : plant , mRNA , rRNA , PNPase , tRNA , mitochondria , clones , nuclei plante , ARNm , ARNr , PNPase , ARNt , mitochondrie , clones, noyau
Mots-clés :
  • Arabis thaliana - Thèses et écrits académiques
  • Mitochondries végétales - Thèses et écrits académiques
  • Transcription génétique - Thèses et écrits académiques
  • Acides nucléiques - Thèses et écrits académiques
  • Génome mitochondrial - Thèses et écrits académiques
  • Stabilité de l'ARN - Thèses et écrits académiques
  • Polyribonucleotide nucleotidyltransferase - Thèses et écrits académiques
  • Signaux de polyadénylation - Thèses et écrits académiques
Résumé : Le rôle de la PolyNucleotide Phosphorylase (PNPase) mitochondriale de plante dans la dégradation de précurseurs d'ARNm et ARNr et sous-produits de leur maturation avait été montré précédemment. Tous les substrats de la PNPase sont polyadénylés. Le but de ce travail était d'avoir une idée plus exhaustive de l'identité des substrats de la PNPase par l'analyse d'une banque de cDNAs polyadénylés à partir de plantes déplétées pour la PNPase mitochondriale. Ainsi, nous avons pu généraliser le rôle de la PNPase dans l'élimination des sous-produits de la maturation des ARNr et ARNt. De plus, nous avons décrit un nouveau rôle de la PNPase dans la dégradation de transcrits illégitimes générés par un contrôle relâché de la transcription, dans le contexte d'une surveillance par défaut dans les mitochondries de plantes. L'analyse des ARN polyadénylés nous a permis d'identifier un transcrit modèle pour l'étude de la maturation en 3 , indépendamment de la PNPase. Nous avons démontré qu un trans facteur spécifique était nécessaire à la maturation en 3 de ce transcrit, appelé NCO et que les processus de maturation et de stabilisation pouvaient être découplés dans la mitochondrie de plante. La présence de séquences correspondant à des ARN nucléaires dans la banque de clones polyadénylés nous a poussé à étudier la possibilité de l'existence d'une voie de dégradation des ARNs impliquant la polyadénylation dans les noyaux de plantes. Nous avons identifié 3 gènes codant pour les protéines RRP6L1, RRP6L2 et RRP6L3, respectivement. RRP6L3 semble être spécifique aux plantes et est localisée dans le cytoplasme, tandis que RRP6L1 et RRP6L2, qui occupent des territoires distincts du noyau, sont plus proches de la protéine Rrp6p de levure, une sous-unité nucléaire de l'exosome. L'accumulation d'un sous-produit polyadénylé de la maturation d'un ARNr lors de la sous-expression de RRP6L2 corrobore l'existence d'une voie de dégradation des ARNs assistée par la polyadénylation dans le noyau des plantes.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-296649
Type de ressource : Thèse