Universalité des méthodologies protéomiques pour l'identification et la caractérisation des protéines
Langue Français
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Auteur : Fouillen, Laetitia
Date de soutenance : 25-06-2009

Directeur(s) de thèse : Van Dorsselaer, Alain

Établissement de soutenance : Université de Strasbourg
École doctorale : École doctorale Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie physique
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : spectrométrie de masse , chromatographie liquide , modifications post-traductionnelles , méthodologies protéomiques
Mots-clés :
  • Protéomique - Thèses et écrits académiques
  • Protéines - Thèses et écrits académiques
Résumé : La grande diversité des problèmes biologiques abordés ces dernières années par l'analyse protéomique a montré que celle-ci devait être encore développée en fonction du type de question posée mais aussi en fonction des contraintes techniques imposées par les échantillons. Les méthodologies protéomiques sont composées de plusieurs étapes mettant en jeu la préparation d'échantillon, la séparation des protéines et peptides et enfin l'analyse des protéines et peptides par spectrométrie de masse suivie de l'interprétation des données générées. Les études présentées ont nécessité d'adapter ces différentes étapes pour répondre au mieux aux diverses questions biologiques abordés au cours de cette thèse : L'identification des protéines impliquées dans des complexes protéine/protéine et ARN/protéine : une stratégie protéomique impliquant une purification du complexe d'intérêt et des analyses par nanoLC-MS/MS a pu être développée. La caractérisation fine des protéines phosphorylées purifiées : une méthodologie adaptée, en deux étapes, a été mise en place pour la détermination de l'état de phosphorylation des protéines entières et la localisation des sites exacts de phosphorylation sur le squelette peptidique. L'identification et la quantification relative des protéines plasmatiques exprimées chez le manchot Adélie lors du jeûne prolongé à l'aide d'une stratégie de quantification par analyse d'image et d'une stratégie d'identification par des approches d'interprétation des données MS/MS. Ces travaux de thèse montrent l'universalité des approches protéomiques, qui devront toujours être adaptées très finement pour garder leur potentiel pour l'analyse d'échantillons provenant d'origines diverses et de complexités variables.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-298099
Type de ressource : Thèse