Identification et caractérisation des gènes cibles du corépresseur TIF1b : vers une meilleure compréhension de son rôle en tant que régulateur épigénétique de l'activité transcriptionnelle du génome murin
Langue Français
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Auteur : Riclet, Raphaël
Date de soutenance : 11-09-2009

Directeur(s) de thèse : Cammas, Florence. - Losson, Régine


Établissement de soutenance : Université de Strasbourg
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Protéines
Mots-clés :
  • Protéines - Thèses et écrits académiques
  • Épigénétique - Thèses et écrits académiques
  • Répresseurs - Thèses et écrits académiques
  • Transcription génétique - Thèses et écrits académiques
Résumé : Mon travail de thèse a porté sur l'identification et la caractérisation des gènes directement régulés par TIF1b dans les cellules de carcinome embryonnaire F9. Par analyse transcriptomique et ChIP, nous avons identifié MEST comme un gène cible primaire de TIF1b. Nous avons ensuite démontré que TIF1b est essentiel à l'établissement et à la maintenance d'une structure de type hétérochromatine dans la région promotrice de ce gène, caractérisée par la triméthylation de H3K9 et de H4K20, l' hyperméthylation de l'ADN et un enrichissement en protéines HP1. Enfin, cette structure semble entrainer une localisation préférentielle du gène MEST à proximité de l'hétérochromatine. Nous avons démontré que cette organisation nécessite l'interaction entre TIF1b et les HP1, puisqu elle est complètement perturbée dans des cellules F9 qui expriment une protéine TIF1b n interagissant plus avec les protéines HP1. Dans ces cellules, le promoteur MEST est hypométhylé et caractérisé par une triméthylation de H3K27, associée à la réactivation de l'expression de ce gène et à son éloignement de l'hétérochromatine.Par des expériences de ChIP-seq réalisées dans des cellules F9 au cours de la différenciation cellulaire, nous avons mis en évidence un grand nombre de régions du génome enrichies en TIF1b correspondant principalement à des régions promotrices proximales et distales. Cette étude nous a permis d'établir que TIF1b régule majoritairement des gènes impliqués dans l'expression des gènes, la mort cellulaire, la croissance et la prolifération cellulaire ainsi que dans le cancer; cette analyse suggère aussi que TIF1b pourrait jouer un rôle au niveau des séquences répétées de type LTR et SINE.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-298289
Type de ressource : Thèse