Diversité des mécanismes d'oxydo-réduction de l'arsenic chez les bactéries : des souches cultivables aux communautés
Langue Français
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Auteur : Heinrich-Salmeron, Audrey
Date de soutenance : 06-11-2009

Directeur(s) de thèse : Lett, Marie-Claire

Établissement de soutenance : Université de Strasbourg
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : arsenic , diversity , arsenite oxidizing bacteria , aox genesarsenic , diversité , bactéries arsénite-oxydantes , gènes aox
Mots-clés :
  • arsenic--oxydation - Thèses et écrits académiques
  • oxydoreduction - Thèses et écrits académiques
  • arsenites (chimie) - Thèses et écrits académiques
  • bacteries - Thèses et écrits académiques
Résumé : Les bactéries sont retrouvés dans des milieux très variés allant des plus communs aux plus extrêmes, comme les sites miniers arséniés de Carnoulès, de Salsigne ou de Sainte-Marie-aux-Mines. De nombreuses bactéries sont impliquées dans le cycle bio-géochimique de l'arsenic et jouent un rôle crucial dans sa biodisponibilité. Certaines possèdent l'arsénite-oxydase (Aox) qui catalyse l'oxydation de l'AsIII en AsV, constituant la première étape de détoxication. L'objectif de ce travail est d'étudier la diversité des mécanismes d'oxydo-réduction de l'arsenic chez les bactéries. Mon travail s'est focalisé sur l'analyse de la diversité des gènes aox observée chez des isolats en condition de laboratoire et au sein de communautés complexes en conditions in situ. Ces travaux ont conduit à la caractérisation de trois souches : Pseudomonas S11, Leptothrix S1.1 et Thiomonas 3As. Une analyse génétique a complété l'analyse physiologique de Thiomonas. Ces études ont de plus conduit à la mise en évidence d'arsénite-oxydases particulières dont l'activité est exprimée de manière constitutive ou présentant une activité enzymatique élevée. Puis l'analyse des séquences AoxB issues de diverses bactéries cultivables et de communautés bactériennes a permis la mise en évidence d'une variabilité de séquences AoxB et nous a conduit à proposer le gène aoxB comme marqueur moléculaire des bactéries arsénite-oxydantes aérobies. Enfin l'analyse des gènes aox par une étude de génomique environnementale sur la communauté bactérienne du site de Carnoulès, a permis de mieux appréhender les interactions trophiques entre les souches et de mettre en évidence le rôle pivot de Thiomonas sp. dans cet environnement.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-299019
Type de ressource : Thèse