Analyse de polymorphismes ponctuels d'ADN extraits de tissus humains anciens : application à l'étude de populations sibériennes anciennes
Langue Français
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Auteur : Bouakaze, Caroline
Date de soutenance : 15-02-2010

Directeur(s) de thèse : Ludes, Bertrand

Établissement de soutenance : Université de Strasbourg
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé

Mots-clés libres : ADN ancien , polymorphismes ponctuels (SNP) , Sibérie , tuberculose , miniséquençage , spectométrie de masse MALDI-TOF , tissus humains
Mots-clés :
  • Polymorphisme génétique - Thèses et écrits académiques
  • Paléogénétique - Thèses et écrits académiques
  • ADN fossile - Thèses et écrits académiques
  • Tuberculose - Thèses et écrits académiques
Résumé : Dans ce travail de thèse, une approche méthodologique originale basée sur l'analyse de différents polymorphismes ponctuels (ou SNP) a été utilisée sur des échantillons anciens dans le but d'étudier l'histoire de populations sibériennes du passé. Des SNP du génome humain ont été analysés à partir d'échantillons anciens provenant du Sud de la Sibérie afin d'apporter de nouveaux éléments quant au peuplement de cette région. Les données génétiques obtenues indiquent qu aux Ages du Bronze et du Fer, cette région était peuplée de sujets au teint pâle, aux cheveux clairs et aux yeux bleus qui étaient originaires d'Europe de l'Est. Ces résultats ont permis de mettre en évidence l'existence de mouvements de populations d'Europe de l'Est jusqu au Sud de la Sibérie avant 1800 avant J.-C. De plus, au vu de données archéologiques et linguistiques, il semblerait que ces mouvements puissent être liés à l'expansion vers l'Est de peuples ayant parlé le proto indo-européen. L'analyse de SNP du génome d'agents pathogènes responsables de la tuberculose menée à partir de vertèbres yakoutes présentant des lésions osseuses évocatrices d'une atteinte tuberculeuse a permis d'appréhender l'état sanitaire de la population yakoute (Sibérie Orientale). En effet, le fait d'avoir pu diagnostiquer la tuberculose chez 3 de ces sujets et d'identifier M. tuberculosis comme agent responsable de l'infection a apporté, pour la première fois, la preuve de la présence de la tuberculose humaine en Yakoutie aux XVIIème et XVIIIème siècles. La qualité des résultats obtenus ainsi que les hypothèses originales qui ont pu être proposées attestent de l'intérêt que présente l'analyse de SNP pour les études d'ADN ancien.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-299759
Type de ressource : Thèse