Caractérisation structurale et fonctionnelle de déterminants de la capside du Grapevine fanleaf virus impliqués dans la transmission par Xiphinema index
Langue Français
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Auteur : Schellenberger, Pascale
Date de soutenance : 07-06-2010

Directeur(s) de thèse : Ritzenthaler, Christophe - Lemaire, Olivier

Établissement de soutenance : Université de Strasbourg
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : vigne , grapevine fanleaf virus
Mots-clés :
  • Vigne - Thèses et écrits académiques
  • Maladies à virus - Thèses et écrits académiques
  • Protéines virales - Thèses et écrits académiques
Résumé : La transmission des virus est une étape cruciale du cycle viral. Le Grapevine fanleaf virus (GFLV) et l'Arabis mosaic virus (ArMV), les principaux agents de la maladie du court-noué de la vigne, sont transmis spécifiquement par deux espèces de nématodes, respectivement Xiphinema index et X. diversicaudatum. Des résultats antérieurs ont montré que la protéine de capside (CP) du GFLV détermine sa transmission. Pour caractériser les régions de la CP impliquées dans la vection du GFLV, nous avons combiné génétique inverse, modélisation 3D par homologie, cristallographie aux rayons X et cryomicroscopie électronique (cryo-ME). Plusieurs régions de la CP ont été échangées entre GFLV et ArMV. L'évaluation de la transmission des chimères a montré qu une région de 11 résidus de la CP du GFLV est requise pour sa vection. Par ailleurs, la caractérisation d'un variant spontané du GFLV (TD) faiblement transmis, a révélé l'importance de la mutation Gly297Asp dans la transmission. La structure cristallographique du GFLV (3 °A) et du GFLV-TD (2,7 °A), montre que la perte de transmission du variant a pour origine la présence d'une chaîne latérale chargée négativement exposée à la surface du virus. Ces données suggèrent qu une cavité de surface formée par le domaine B de la CP, serait le site de reconnaissance virus-vecteur. Enfin, la structure de l'ArMV a été obtenue par reconstruction 3D à partir d'images de cryo-ME. La comparaison du GFLV à l'ArMV suggère l'existence de différences structurales au niveau de la cavité. L'ensemble de ce travail ouvre de nouvelles perspectives de recherche visant à comprendre les bases moléculaires de la transmission des Nepovirus par nématodes.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-303881
Type de ressource : Thèse