Protéomique qualitative et quantitative, une passerelle pour relier l'expression génomique à la construction des édifices biologiques : application à la compréhension de la structure moléculaire du cheveu humain
Langue Français
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Auteur : Barthélemy, Nicolas
Date de soutenance : 22-06-2011

Directeur(s) de thèse : Van Dorsselaer, Alain


Établissement de soutenance : Université de Strasbourg
École doctorale : École doctorale Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie analytique
Classification : Génie chimique, technologies alimentaires

Mots-clés libres : analyse protéomique , cheveu , protéines associées aux kératines , familles multigéniques , caractérisation , structure , plan d'expérience , nanoLC-ESI-Q-TOF
Mots-clés :
  • Protéines - Thèses et écrits académiques
  • Protéomique - Thèses et écrits académiques
  • Empreintes génomiques - Thèses et écrits académiques
  • Cheveux - Thèses et écrits académiques
  • Structure moléculaire - Thèses et écrits académiques
Résumé : La fibre capillaire est un édifice biologique complexe dont le détail de la structure moléculaire est encore mal appréhendé principalement du fait du manque de précision concernant l'expression et l'organisation des protéines la constituant. Dans ce contexte, l'utilisation des approches protéomiques pour améliorer la connaissance des cellules spécifiques du cheveu humain a été développée au cours de cette thèse. Ce travail s'est articulé autour de quatre parties : l'établissement des connaissances de la biologie du cheveu et de ses structures moléculaires obtenues à partir des données de la littérature. La mise au point d'une stratégie protéomique adaptée aux cas très particuliers des protéines du cheveu et reposant en partie sur l'optimisation du couplage nanoLC-ESI-Q-TOF pour le séquençage peptidique à haut débit. L'isolement de deux types cellulaires pour en étudier précisément le protéome : les cellules du cortex et de la cuticule du cheveu. La comparaison de l'expression semi quantitative des protéines identifiées a permis de proposer la spécificité de localisation d'une partie d'entre elles dans ces protéomes. Ces analyses ont conduit à la démonstration de l'expression de 60% des gènes de protéines associées aux kératines (KAP) prédits contre 20% auparavant complétant ainsi la liste des gènes exprimés en protéines chez l'humain (source Uniprot). L'utilisation d'approches complémentaires pour tenter d'affiner la quantification des protéines majoritaires des cellules corticales, de mettre en évidence des propriétés structurales de certaines de ces séquences protéiques et de proposer des hypothèses quant à l'origine des principaux gènes des KAP.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-306817
Type de ressource : Thèse