Mécanisme moléculaire des propriétés chaperonnes de la protéine core du virus de l'hépatite C : étude physicochimique par fluorescence et résonance plasmonique de surface
Langue Anglais
Accéder à la thèseDroits d'accès : non autorisé

Ce document est protégé en vertu du Code de la Propriété Intellectuelle.

 
Auteur : Sharma, Kamal Kant
Date de soutenance : 02-05-2011

Directeur(s) de thèse : Mély, Yves - Lessinger, Jean-Marc

Établissement de soutenance : Université de Strasbourg
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Biophysique et biologie structurale
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé

Mots-clés libres : virus de l'hépatite C , hépatite C (HCV) , protéine chaperonne , prolifération cellulaire , différentiation , encapsidation de l'ARN , nucléocapside , variabilité génétique
Mots-clés :
  • Virus de l'hépatite C - Thèses et écrits académiques
  • Chaperons moléculaires - Thèses et écrits académiques
  • Régulation génétique - Thèses et écrits académiques
  • ARN viral - Thèses et écrits académiques
  • Interactions ARN-protéine - Thèses et écrits académiques
  • Fluorescence - Thèses et écrits académiques
  • Résonance plasmonique de surface - Thèses et écrits académiques
Résumé : La protéine core de virus de l'hépatite C (HCV) est l'une des dix protéines codées par l'ARN génomique de 9.6kb du virus. C est une protéine chaperonne multifonctionnelle impliquée dans plusieurs processus viraux comme la prolifération cellulaire, la différentiation, l'encapsidation de l'ARN, la formation de la nucléocapside, et la variabilité génétique. Grâce à ses propriétés de chaperonne, le domaine D1 dimérise la région 3 non traduite (3 UTR) de l'ARN génomique. Cependant le mécanisme de cette activité chaperonne ainsi que l'interaction entre la protéine Core et différents oligonucléotides de la partie 3 de l'ARN restent inconnus. Dans ce but, nous avons utilisé différentes approches de fluorescence et la résonance plasmonique de surface. Ainsi, en utilisant le peptide D1, correspondant à un fragment de la protéine core, ainsi que plusieurs dérivés de ce peptide nous avons caractérisé les paramètres de l'interaction et montré que la protéine core se lie spécifiquement aux oligonucléotides en tige-boucle de la partie 3 . Ensuite, nous avons suivi la conformation de ces oligonucléotides et montré que la protéine core n est pas capable de déstabiliser leur structure secondaire. Enfin, nous avons décrit au niveau moléculaire le mécanisme permettant à la protéine core d'hybrider des oligonucléotides complémentaires et montré que la cinétique d'hybridation repose sur une réaction à deux étapes impliquant un contact boucle-boucle. Ce travail devrait nous permettre de mieux comprendre le rôle de la protéine core lors de l'encapsidation et la transcription de l'ARN et notamment dans les mécanismes de recombinaison expliquant les variations génétiques du virus.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-306967
Type de ressource : Thèse