Mise en évidence et analyse d un riboswitch appartenant à la famille des T-Box contrôlant l expression des enzymes de la voie ARNt-dépendante de formation d asparagine chez Clostridium acetobutylicum
Langue Anglais
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Auteur : Saad, Nizar
Date de soutenance : 30-10-2011

Directeur(s) de thèse : Becker, Hubert - Kern, Daniel

Établissement de soutenance : Université de Strasbourg
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : riboswitch, T-Box, ARNt-dépendante, Clostridium acetobutylicum, bactéries gram positive
Mots-clés :
  • Clostridium acetobutylicum - Thèses et écrits académiques
  • Riborégulateurs - Thèses et écrits académiques
  • Asparagine - Thèses et écrits académiques
  • ARN de transfert - Thèses et écrits académiques
  • Régulation génétique - Thèses et écrits académiques
Résumé : Ce projet a permis de comprendre au niveau structural et mécanistique le fonctionnement du système d'antiterminaison chez Clostridium acetobutylicum et de conclure que ce mécanisme de régulation de l'expression des gènes est totalement dépendant du contexte physiologique de chaque espèce bactérienne. La redondance des gènes de la synthèse de l'Asn-ARNtAsn chez C. acetobutylicum a permis de révéler un mécanisme complexe de régulation de ces gènes en réponse au stress environnemental et aux changements physiologiques subis par C. acetobutylicum. Ce mécanisme est basé sur la régulation au niveau transcriptionnel de l'expression des gènes codant pour la voie indirecte de synthèse de l'Asn-tRNAAsn. Durant notre recherche on a montré que cette régulation est effectuée par un riboswitch de type T-Box spécifique d'un ARN de transfert, l'ARNtAsn. L'utilisation d'une combinaison d'études in vitro et in vivo, a permis de montré une ambigüité dans l'usage du codon au niveau de la spécifier loop de cette T-Box. Cette ambigüité permet la reconnaissance des deux espèces d'ARNt; l'ARNtAsn(GUU) et l'ARNtGlu(UUC). Enfin, la découverte de la synchronisation de 2 riboswitch de type T-Box est une découverte majeure qui permettra une avancée dans la compréhension du rôle de la T-Box dans son contexte cellulaire. Ces découvertes ouvrent la voie à une meilleure compréhension de la régulation des gènes chez les bactéries Gram positives pathogènes qui dans leur grande majorité utilisent ce riboswitch.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-307097
Type de ressource : Thèse