La dimérisation de l'ARN génomique du virus de l'immunodéficience humaine de type 1 (HIV-1) : rôle dans l'encapsidation sélective et l'épissage
Langue Français
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Auteur : Sinck, Lucile
Date de soutenance : 29-11-2010

Directeur(s) de thèse : Paillart, Jean-Christophe

Établissement de soutenance : Université de Strasbourg
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : rétrovirus , VIH , ARN , DIS , dimérisation , sélection , encapsidation , épissage
Mots-clés :
  • VIH (virus) - Thèses et écrits académiques
  • ARN - Thèses et écrits académiques
  • Dimères - Thèses et écrits académiques
  • Multimérisation de protéines - Thèses et écrits académiques
  • Épissage (génétique) - Thèses et écrits académiques
  • VIH-1 (Virus de l'Immunodéficience Humaine de type 1) - Thèses et écrits académiques
Résumé : La nature diploïde du génome viral est une caractéristique spécifique et conservée à l'ensemble des rétrovirus, mettant en évidence le rôle crucial de la dimérisation dans le cycle réplicatif. Par ailleurs, les domaines de dimérisation et d'encapsidation, situés à l'extrémité 5 UTR de l'ARNg, se superposent et des mutations à l'origine de défauts de dimérisation réduisent l'efficacité d'encapsidation de l'ARNg, suggérant que la dimérisation serait impliquée dans le processus de sélection du génome viral. Or, le site d'initiation de la dimérisation (DIS) est présent sur tous les ARN viraux (génomique et épissés) et pourrait ainsi favoriser l'encapsidation des ARN épissés sous forme d'hétérodimères avec l'ARNg. En analysant la capacité de dimérisation des ARN viraux, nous avons montré qu in vitro les ARN épissés sont capables d'homodimériser et d'hétérodimériser avec l'ARNg par l'intermédiaire du DIS. Cependant, à l'inverse de l'ARNg, bien que le DIS des ARN épissés soit fonctionnel in vitro, il ne favorise pas leur encapsidation et ceux-ci sont largement exclus des particules virales, suggérant l'existence d'un système de discrimination des ARN conduisant à la sélection spécifique de l'ARNg. La localisation du DIS à proximité du site majeur d'épissage nous a alors conduit à analyser le lien possible entre la dimérisation et l'épissage des ARN viraux, qui pourrait moduler le processus de sélection de l'ARNg. Nous avons montré que le DIS et/ou la dimérisation régulent négativement l'épissage et positivement l'encapsidation. Ainsi les mécanismes de dimérisation et d'épissage pourraient entrer en compétition et favoriser l'encapsidation sélective de l'ARNg.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-307117
Type de ressource : Thèse