Évaluation de la contamination bactériologique des eaux usées des stations d'épuration du Grand Agadir : isolement, caractérisation moléculaire et antibiorésistance des espèces du genre Vibrio
Langue Français
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Auteur : Eddabra, Rkia
Date de soutenance : 29-10-2011

Directeur(s) de thèse : Mimouni, Rachida - Scheftel, Jean-Michel

Établissement de soutenance : Université de Strasbourg
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Sciences de la vie et de la santé
Classification : Sciences de l'ingénieur

Mots-clés libres : eaux usées , station d'épuration , Vibrio , bactéries fécales , résistance aux antibiotiques , spectrométrie de masse MALDI-TOF , électrophorèse en champ pulsé , physico-chimie
Mots-clés :
  • Eaux usées - Thèses et écrits académiques
  • Bactéries pathogènes - Thèses et écrits académiques
  • Vibrio - Thèses et écrits académiques
  • Contamination - Thèses et écrits académiques
Résumé : Au Maroc et principalement dans la Wilaya d'Agadir trois stations d'épuration des eaux usées fonctionnant selon la technique d'infiltration-percolation sur sable ont été mises en place. L'objectif de cette étude est de déterminer les caractéristiques physico-chimiques, bactériologiques, ainsi que l'étude des souches de Vibrio isolées de 3 stations d'épuration de la ville. Les résultats d'abattement des bactéries indicatrices de contamination fécale entre l'entrée et la sortie des 3 stations d'épuration dépassent les 99%. La qualité des eaux épurées issues des 3 STEPs échantillonnées Ben Sergao, Drarga et L'Mzar, est de type A selon les recommandations de l'OMS (1989), mais il faut que le nombre des oeufs d'helminthes soit moins de 1/L'pour une réutilisation en irrigation de façon non restrictive. Au cours de cette étude et après identification par le système Vitek 2 et/ou par PCR, sérotypage, 58 souches de Vibrio ont été isolées et analysées. Cette population est représentée par quatre espèces : 31 souches de V. cholerae non-O1, 17 souches de V. alginolyticus, 9 souches de V. fluvialis et une souche de V. metschnikovii. 53,44% des souches de Vibrio isolées ont un phénotype sauvage, 46,56% des souches présentent le phénotype pénicillinase à bas niveau ou phénptype céphalosporinase à bas niveau. L'étude des profils de migration électrophorètique de l'ADN total après macro restriction enzymatique par NotI, a révélé un degré important d'hétérogénéité des souches de Vibrio. La spectrométrie de masse MALDI TOF a été utilisée pour identifier et classer des souches de Vibrio. La qualité d'identification par cette technique est fonction de la richesse de la banque de spectres enregistrés.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-307517
Type de ressource : Thèse