Nouveaux lipides bicaténaires polyfonctionnels : enjeux synthétiques et analytiques, applications biochimiques
Langue Français
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Auteur : Hilbold, Benoît
Date de soutenance : 09-12-2011

Directeur(s) de thèse : Bourel-Bonnet, Line - Pécheur, Eve-Isabelle


Établissement de soutenance : Université de Strasbourg
École doctorale : École doctorale Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie
Classification : Chimie, minéralogie, cristallographie, Génie chimique, technologies alimentaires, Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : virus , peptide de fusion , protéine membranaire , photomarquage , sonde lipidique , fluorescence , benzophénone , spectrométrie de masse
Mots-clés :
  • Hépatovirus - Thèses et écrits académiques
  • Protéines virales enveloppe - Thèses et écrits académiques
  • Fusion membranaire - Thèses et écrits académiques
  • Marquage par photoaffinité - Thèses et écrits académiques
  • Sondes moléculaires - Thèses et écrits académiques
  • Fluorescence - Thèses et écrits académiques
  • Spectroscopie de masse - Thèses et écrits académiques
Résumé : Les pathogènes comme les virus Ebola, de l'hépatite C ou du VIH sont, dans la plupart des cas, mortels et représentent une menace sérieuse pour la santé humaine dans le monde. Ces virus à enveloppe sont difficiles à étudier parce qu ils doivent être manipulés dans des laboratoires de niveau de sécurité 3 ou 4. Malgré ces difficultés, la compréhension de l'interaction entre les protéines d'enveloppe d'un virus donné et la membrane cellulaire lors de l'étape d'infection de la cellule cible par le virus est essentielle. Il s'agit de mieux caractériser ce processus d'infection et d'essayer de trouver un procédé d'inhibition de celui-ci à un stade précoce de l'infection. Certaines de ces protéines d'enveloppe, les protéines de fusion virale, sont plus particulièrement impliquées lors de l'étape de fusion virale. Cette étape conduit à la délivrance du matériel génétique viral dans la cellule cible. Deux éléments structurels jouent un rôle crucial lors de l'étape de fusion : le peptide de fusion et le domaine transmembranaire de la protéine de fusion virale. La cartographie de ces régions-clés portées par cette protéine est donc cruciale pour la compréhension des relations structure/fonction au cours du processus de fusion. Nous proposons donc une stratégie pour identifier les régions hydrophobes des protéines de fusion virale impliquant un photomarquage covalent d'affinité hydrophobe. Cette stratégie est basée sur l'utilisation de pseudo-particules virales non pathogènes ou de virus comme le virus de l'hépatite B comme modèle permettant l'exécution de celle-ci dans un laboratoire de niveau de sécurité 1 ou 2 moins contraignant. Cette approche repose sur l'utilisation de nouvelles sondes lipidiques (2 chaînes grasses) contenant un groupement photoactivable sur une des chaînes grasses (la benzophénone) et un traceur (fluorescent : la rhodamine ou de la biotine) pour la détection et/ou la purification des adduits formés lors de la réaction de marquage.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-308027
Type de ressource : Thèse