Analyse et exploitation de données de criblages de réactions chimiques pour la recherche de voies de synthèse
Langue Français
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Auteur : Lienhart, Yann
Date de soutenance : 16-12-2011

Directeur(s) de thèse : Wurtz, Jean-Marie

Établissement de soutenance : Université de Strasbourg
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Bioinformatique
Classification : Informatique, Chimie, minéralogie, cristallographie

Mots-clés libres : chemo-informatique , bio-informatique , bases de données , Java , Java EE , spectrométrie de masse , chromatographie en phase gazeuse , logiciel
Mots-clés :
  • Criblage pharmacologique - Thèses et écrits académiques
  • Chimie - Thèses et écrits académiques
  • Bioinformatique - Thèses et écrits académiques
Résumé : Les bases de données en chimie sont généralement centrées sur les molécules et les informations concernant les réactions sont extraites des publications scientifiques. Ces informations sont généralement disponibles dans des conditions expérimentales particulières et peu de données sont disponibles au sujet des réactions à faible rendement ou qui n ont pas fonctionnées. En conséquence il peut être difficile de comparer les réactions et les transformations chimiques entre elles en raison de ces conditions expérimentales spécifiques et de ces données manquantes. Cette thèse a été financée par la société NovAlix (CIFRE), spécialisée en chimie organique et en biologie structurale. Afin d'explorer rapidement l'espace chimique et d'améliorer le processus de synthèse de molécules, deux méthodes d'expérimentation à haut débit ont été mises au point au sein de la société. Ces méthodes s'appuient sur la chromatographie en phase gazeuse et sur la spectrométrie de masse pour l'analyse des milieux réactionnels. La plate-forme informatique Magellan développée au cours de cette thèse est mise en œuvre grâce aux technologies Java Enterprise Edition et s'appuie sur une base de donnée centrée autour de la réaction chimique. Cet application permet la lecture, l'analyse et le stockage des données expérimentales récoltées par les méthodes d'expérimentation à haut débit de NovAlix et fournit des outils informatiques facilitant l'analyse des spectres expérimentaux et permettant la formulation de requêtes sur les expériences ainsi enregistrées.
 
Type de contenu : Text
 
Entrepôt d'origine : Ressource locale
Identifiant : ecrin-ori-308257
Type de ressource : Thèse