Évaluation de l'impact clinique d'explorations génomiques lages au diagnostic de 198 tumeurs solides pédiatriques:une étude monocentrique:Thèse présentée pour le diplôme d'État de docteur en médecine. Diplôme d'État mention pédiatrie
Langue Français
Langue Français
Auteur(s) : Simon, Juliette
Directeur : Natacha Entz-Werle
Composante : MEDECINE
Date de création : 30-06-2023
Description : Médecine (pédiatrie), Contexte : Face au développement croissant des analyses moléculaires systématiques dans les cancers pédiatriques en rechute qui font progresser la recherche en oncologie pédiatrique et montrent une utilité clinique, cette étude visait à évaluer l'impact clinique des explorations génomiques systématiques réalisées au diagnostic de cancers solides pédiatriques en vue d'une application en routine. Méthodes : Au total, 280 patients de moins de 22 ans, atteints d'une tumeur solide diagnostiquée de janvier 2015 à décembre 2021 à l'hôpital de Strasbourg, ont été analysés. Parmi eux, 198 (71%) ont bénéficié d'une biologie moléculaire (BM) au diagnostic, sous forme d'analyses à large spectre (séquençage ARN, Next Generation Sequencing , FoundationOne CDx) et/ou d'analyses ciblées (IHC, FISH, RT PCR, séquençage Sanger, PCR digitale). Les anomalies moléculaires et les stratégies d’exploration de BM ont été décrites, et l'utilité clinique de la biologie moléculaire a été évaluée (modification du diagnostic, du pronostic ou du traitement). Résultats : 38 histologies différentes ont été regroupées en tumeurs du SNC (30 %), sarcomes (26 %, os et tissus mous) et divers blastomes malins (27 %). Sur un suivi médian de 40 mois, le taux de survie globale des patients était de 85% et le taux de rechute de 28%. Sur les 342 analyses réalisées, 245 anomalies (SNV : 50%, fusions : 25%, CNV : 20%) concernant 70 oncogènes ont été mises en évidence. Le taux d'impact clinique global est de 84% ; les analyses à large spectre ont un impact thérapeutique plus élevé (57%) que les analyses ciblées (28%). 75 % des analyses à large spectre ont mis en évidence un variant exploitable ; 23 % des patients ont reçu une thérapie ciblée adaptée lors de la rechute. Conclusion : Notre expérience a mis en évidence l'utilité clinique du profilage moléculaire des tumeurs solides dès le diagnostic chez les enfants., Background : In view of the increasing development of systematic molecular analyses in relapsed pediatric cancers, which are advancing research in pediatric oncology and showing clinical utility, this study aimed to evaluate the clinical impact of systematic genomic explorations performed at the diagnosis of pediatric solid cancers for routine application. Methods : A total of 280 patients under 22 years of age with a solid tumor diagnosed from January 2015 to December 2021 at the Strasbourg hospital were analyzed. Among them, 198 (71%) benefited from molecular biology (BM) at diagnosis, with broad-spectrum analyses (RNA sequencing, Next Generation Sequencing , FoundationOne CDx) and/or targeted analyses (IHC, FISH, RT PCR, Sanger sequencing, digital PCR). Molecular abnormalities and exploration strategies of BM were described, and the clinical utility of molecular biology was evaluated (modification of diagnosis, prognosis or treatment). Results : 38 different histologies were grouped into CNS tumors (30%), sarcomas (26%, bone and soft tissue), and various malignant blastomas (27%). Over a median 40 months follow-up, the overall survival rate of patients was 85% and the relapse rate was 28%. Of the 342 analyses performed, 245 abnormalities (SNV: 50%, fusions: 25%, CNV: 20%) concerning 70 oncogenes were identified. The overall clinical impact rate is 84%; broad-spectrum analyses have a higher therapeutic impact (57%) than targeted analyses (28%). 75% of the broad-spectrum assays identified a targetable variant; 23% of patients received appropriate targeted therapy at relapse. Conclusion : Our experience has demonstrated the clinical utility of molecular profiling of solid tumors at diagnosis in solid tumors at diagnosis in children., Thèses et écrits académiques
Mots-clés libres : Médecine de précision, Tumeurs, Séquençage à haut débit, Profilage génomique tumoral, Thérapies ciblées, Neuro oncologie , 618.92
Couverture : FR
Directeur : Natacha Entz-Werle
Composante : MEDECINE
Date de création : 30-06-2023
Description : Médecine (pédiatrie), Contexte : Face au développement croissant des analyses moléculaires systématiques dans les cancers pédiatriques en rechute qui font progresser la recherche en oncologie pédiatrique et montrent une utilité clinique, cette étude visait à évaluer l'impact clinique des explorations génomiques systématiques réalisées au diagnostic de cancers solides pédiatriques en vue d'une application en routine. Méthodes : Au total, 280 patients de moins de 22 ans, atteints d'une tumeur solide diagnostiquée de janvier 2015 à décembre 2021 à l'hôpital de Strasbourg, ont été analysés. Parmi eux, 198 (71%) ont bénéficié d'une biologie moléculaire (BM) au diagnostic, sous forme d'analyses à large spectre (séquençage ARN, Next Generation Sequencing , FoundationOne CDx) et/ou d'analyses ciblées (IHC, FISH, RT PCR, séquençage Sanger, PCR digitale). Les anomalies moléculaires et les stratégies d’exploration de BM ont été décrites, et l'utilité clinique de la biologie moléculaire a été évaluée (modification du diagnostic, du pronostic ou du traitement). Résultats : 38 histologies différentes ont été regroupées en tumeurs du SNC (30 %), sarcomes (26 %, os et tissus mous) et divers blastomes malins (27 %). Sur un suivi médian de 40 mois, le taux de survie globale des patients était de 85% et le taux de rechute de 28%. Sur les 342 analyses réalisées, 245 anomalies (SNV : 50%, fusions : 25%, CNV : 20%) concernant 70 oncogènes ont été mises en évidence. Le taux d'impact clinique global est de 84% ; les analyses à large spectre ont un impact thérapeutique plus élevé (57%) que les analyses ciblées (28%). 75 % des analyses à large spectre ont mis en évidence un variant exploitable ; 23 % des patients ont reçu une thérapie ciblée adaptée lors de la rechute. Conclusion : Notre expérience a mis en évidence l'utilité clinique du profilage moléculaire des tumeurs solides dès le diagnostic chez les enfants., Background : In view of the increasing development of systematic molecular analyses in relapsed pediatric cancers, which are advancing research in pediatric oncology and showing clinical utility, this study aimed to evaluate the clinical impact of systematic genomic explorations performed at the diagnosis of pediatric solid cancers for routine application. Methods : A total of 280 patients under 22 years of age with a solid tumor diagnosed from January 2015 to December 2021 at the Strasbourg hospital were analyzed. Among them, 198 (71%) benefited from molecular biology (BM) at diagnosis, with broad-spectrum analyses (RNA sequencing, Next Generation Sequencing , FoundationOne CDx) and/or targeted analyses (IHC, FISH, RT PCR, Sanger sequencing, digital PCR). Molecular abnormalities and exploration strategies of BM were described, and the clinical utility of molecular biology was evaluated (modification of diagnosis, prognosis or treatment). Results : 38 different histologies were grouped into CNS tumors (30%), sarcomas (26%, bone and soft tissue), and various malignant blastomas (27%). Over a median 40 months follow-up, the overall survival rate of patients was 85% and the relapse rate was 28%. Of the 342 analyses performed, 245 abnormalities (SNV: 50%, fusions: 25%, CNV: 20%) concerning 70 oncogenes were identified. The overall clinical impact rate is 84%; broad-spectrum analyses have a higher therapeutic impact (57%) than targeted analyses (28%). 75% of the broad-spectrum assays identified a targetable variant; 23% of patients received appropriate targeted therapy at relapse. Conclusion : Our experience has demonstrated the clinical utility of molecular profiling of solid tumors at diagnosis in solid tumors at diagnosis in children., Thèses et écrits académiques
Mots-clés libres : Médecine de précision, Tumeurs, Séquençage à haut débit, Profilage génomique tumoral, Thérapies ciblées, Neuro oncologie , 618.92
Couverture : FR
Type : Thèse d'exercice
Format : PDF
Source(s) :
Format : PDF
Source(s) :
- http://www.sudoc.fr/270260226
Entrepôt d'origine :
Identifiant : ecrin-ori-344569
Type de ressource : Ressource documentaire
Identifiant : ecrin-ori-344569
Type de ressource : Ressource documentaire