Etude des mutations d'IDH1 et d'IDH2 dans une cohorte strasbourgeoise:mise en place d'une méthode de recherche ciblée dans les LAM par DDPCR
Langue Français
Langue Français
Auteur(s) : Depierreux, Mathilde
Directeur(s) : Laurent Miguet
Composante : PHARMA
Date de création : 17-10-2023
Résumé(s) : L’apparition de nouvelles thérapies ciblées visant les mutations d’IDH1/2 a offert un nouvel axe thérapeutique dans la LAM. Pour s’aligner avec les nouvelles recommandations de l’ELN, préconisant une caractérisation du statut mutationnel d’IDH1/2 en 3 à 5 jours, nous avons mis en place une nouvelle technique de recherche ciblée par ddPCR multiplex. Pour cela, nous avons caractérisé les LAM mutées IDH1/2 par l’étude de leur terrain mutationnel à partir d’une cohorte des séquençages réalisés depuis 2014 et avons étudié les performances de la ddPCR dans cette indication. Ainsi, nous mettons en évidence une différence du terrain mutationnel entre les différents variants d’IDH1/2 dans les LAM, avec les mutations d’IDH1R132 et IDH2R140 majoritairement associées aux LAM mutées NPM1 et aux LAM secondaires reliées à la myélodysplasie (mutations du spliceosome (SRSF2)), à l’inverse des LAM mutées IDH2R172 caractérisées par un contexte de survenu et un terrain mutationnel distinct. Pour finir, la recherche ciblée par ddPCR permet de répondre de manière adéquate à la caractérisation de 99.4%, 99.3% et 96.7% des mutations d’IDH1R132, d’IDH2R140 et d’IDH2R172 dans les LAM avec une LOD à 0.2% et une LOQ à 0.5% ainsi qu’une sensibilité et une spécificité de 98% et 100%., The appearance of new-targeted therapy against IDH1/2 mutations offered a new therapeutic axis in AML. To align with the new recommendations of the ELN group which recommend having the mutational status of IDH1/2 in 3 to 5 days, we set up a new research technique by multiplexed ddPCR. For this, we characterized the mutated IDH1/2 AML by studying their mutational landscape from a cohort of sequencing performed since 2014 and studied the performance of ddPCR in this indication. Thus, we highlight a difference in the mutational landscape between the different variants of IDH1/2 in AML, with IDH1R132 and IDH2R140 mainly associated with NPM1 mutated AML and secondary AML related to myelodysplasia (spliceosome mutations (SRSF2)), unlike IDH2R172 which characterized by a context of occurrence and a distinct mutational field. Finally, the targeted technique by ddPCR allows to respond adequately to the characterization of 99.4%, 99.3% and 96.7% of IDH1R132 mutations, of IDH2R140 and IDH2R172 in AML with a detection limit at 0.2% and a quantification limit at 0.5% along with a sensitivity and specificity of 98% and 100% each.
Discipline : Pharmacie
Mots-clés libres : Leucémie aigüe myéloïde, Thérapie moléculaire ciblée, Isocitrate dehydrogenases Dissertation universitaire, IDH1/2, LAM, ddPCR, IDH1/2, AML, ddPCR, 610
Couverture : FR
Directeur(s) : Laurent Miguet
Composante : PHARMA
Date de création : 17-10-2023
Résumé(s) : L’apparition de nouvelles thérapies ciblées visant les mutations d’IDH1/2 a offert un nouvel axe thérapeutique dans la LAM. Pour s’aligner avec les nouvelles recommandations de l’ELN, préconisant une caractérisation du statut mutationnel d’IDH1/2 en 3 à 5 jours, nous avons mis en place une nouvelle technique de recherche ciblée par ddPCR multiplex. Pour cela, nous avons caractérisé les LAM mutées IDH1/2 par l’étude de leur terrain mutationnel à partir d’une cohorte des séquençages réalisés depuis 2014 et avons étudié les performances de la ddPCR dans cette indication. Ainsi, nous mettons en évidence une différence du terrain mutationnel entre les différents variants d’IDH1/2 dans les LAM, avec les mutations d’IDH1R132 et IDH2R140 majoritairement associées aux LAM mutées NPM1 et aux LAM secondaires reliées à la myélodysplasie (mutations du spliceosome (SRSF2)), à l’inverse des LAM mutées IDH2R172 caractérisées par un contexte de survenu et un terrain mutationnel distinct. Pour finir, la recherche ciblée par ddPCR permet de répondre de manière adéquate à la caractérisation de 99.4%, 99.3% et 96.7% des mutations d’IDH1R132, d’IDH2R140 et d’IDH2R172 dans les LAM avec une LOD à 0.2% et une LOQ à 0.5% ainsi qu’une sensibilité et une spécificité de 98% et 100%., The appearance of new-targeted therapy against IDH1/2 mutations offered a new therapeutic axis in AML. To align with the new recommendations of the ELN group which recommend having the mutational status of IDH1/2 in 3 to 5 days, we set up a new research technique by multiplexed ddPCR. For this, we characterized the mutated IDH1/2 AML by studying their mutational landscape from a cohort of sequencing performed since 2014 and studied the performance of ddPCR in this indication. Thus, we highlight a difference in the mutational landscape between the different variants of IDH1/2 in AML, with IDH1R132 and IDH2R140 mainly associated with NPM1 mutated AML and secondary AML related to myelodysplasia (spliceosome mutations (SRSF2)), unlike IDH2R172 which characterized by a context of occurrence and a distinct mutational field. Finally, the targeted technique by ddPCR allows to respond adequately to the characterization of 99.4%, 99.3% and 96.7% of IDH1R132 mutations, of IDH2R140 and IDH2R172 in AML with a detection limit at 0.2% and a quantification limit at 0.5% along with a sensitivity and specificity of 98% and 100% each.
Discipline : Pharmacie
Mots-clés libres : Leucémie aigüe myéloïde, Thérapie moléculaire ciblée, Isocitrate dehydrogenases Dissertation universitaire, IDH1/2, LAM, ddPCR, IDH1/2, AML, ddPCR, 610
Couverture : FR
Type : Thèse d'exercice, These d'exercice Unistra
Format : PDF
Source(s) :
Format : PDF
Source(s) :
- http://www.sudoc.fr/273373935
Entrepôt d'origine :
Identifiant : ecrin-ori-351538
Type de ressource : Ressource documentaire
Identifiant : ecrin-ori-351538
Type de ressource : Ressource documentaire