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Amélioration et criblages de propriétés d'ARN aptamères fluorogènes en systèmes microfluidiques
Description : Les ARN (Acide RiboNucléique) remplissent de nombreuses fonctions clés dans le vivant. Ils peuvent être support de l'information génétique, régulateurs de celle-ci. Visualiser ces molécules au sein d'une cellule représenterait une étape importante vers une meilleure compréhension de la régulation ...
Mots clés : Régulation génétique, Gènes marqueurs, Microfluidique, Criblage pharmacologique, Tests de criblage à haut débit
Auteur : Autour Alexis
Année de soutenance : 2018
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Amélioration et criblages de propriétés d'ARN aptamères fluorogènes en systèmes microfluidiques
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Aminoacyl-ARNt synthétases mitochondriales humaines : aspects fondamentaux et contribution à la compréhension de pathologies reliées
Description : Les aminoacyl-ARNt synthetases (aaRS) sont impliquées dans le mécanismes de la traduction. Dans les cellules humaines, il existe deux jeux de gènes nucléaires codant pour les aaRS : un pour les aaRS cytosolique (cyt), le second pour les aaRS mitochondriales (mt). Les aaRS mt sont traduites dans ...
Mots clés : Aminoacyl-ARNt synthétases, ARN de transfert, Traduction génétique, Mitochondriopathies
Auteur : Schwenzer Hagen
Année de soutenance : 2013
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Application des nouvelles approches de cristallisation et de cristallographie sérielle à l’étude structurale de complexes enzymes : ARNt
Description : Cette thèse porte sur deux aspects complémentaires, le développement et l’implémentation de nouvelles approches de cristallisation et de cristallographie sérielle ainsi que leur mise en œuvre dans l’étude structurale de complexes enzymes : ARNt. La cristallographie est la méthode la plus employée ...
Mots clés : Complexes multienzymatiques, Bioinformatique structurale, Cristallographie, Microfluidique
Auteur : De Wijn Raphaël
Année de soutenance : 2018
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ARNt "manchots" : structure, fonctionnalité et évolution
Description : Les ARNt sont des molécules adaptatrices reliant l'information génétique de l’ARN messagers à la séquence d'acides aminés primaire des protéines. Les ARNt ont une structure typique, appelée "feuille de trèfle". Certains ARNt mitochondriaux montrent une forte dérivation de cette structure. Un cas ...
Mots clés : Aminoacyl-ARNt synthétases, ARN de transfert, Nématodes entomophages, Mitochondries
Auteur : Jühling Tina
Année de soutenance : 2016
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ARNt "manchots" : structure, fonctionnalité et évolution
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Caractérisation de l'ArgRS mitochondriale humaine et contribution à la compréhension des pathologies liées aux mutations des aminoacyl-ARNt synthétases mitochondriales
Description : Les aminoacyl-ARNt synthétases mitochondriales humaines (aaRS mt) sont des enzymes clés de la traduction mitochondriale. Elles catalysent l'aminoacylation des ARNt par les acides aminés correspondent. Des mutations dans leurs gènes sont corrélées à des pathologies avec un large spectre de phénotypes ...
Mots clés : Aminoacyl-ARNt synthétases, Mitochondries, Traduction génétique, Hypoplasie pontocérébelleuse, Amino acyl-tRNA synthetases
Auteur : Gonzalez Serrano Ligia Elena
Année de soutenance : 2018
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Caractérisation de l'ArgRS mitochondriale humaine et contribution à la compréhension des pathologies liées aux mutations des aminoacyl-ARNt synthétases mitochondriales
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Caractérisation de l'expression des éléments Alu et du phénomène d'édition de l'ARN chez l'humain et la souris
Description : Les éléments Alu sont les retrotransposons les plus prolifiques chez l’humain avec plus d’1 million de copies occupant plus de 10% du génome. Afin de contrecarrer l’expansion des rétro-éléments, les organismes ont développés différents mécanismes pour préserver l’intégrité de leurs génomes. Le plus ...
Mots clés : Éléments génétiques mobiles, Séquence nucléotidique, ARN -- Édition
Auteur : Cattenoz Pierre
Année de soutenance : 2012
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Caractérisation de la machinerie traductionnelle à l'aide de criblages à ultra haut-débit en goutelettes microfluidiques
Description : La traduction est un procédé énergivore finement régulé et ce, majoritairement lors de son initiation. Que ce soit au travers de systèmes procaryotes ou eucaryotes, l’étude de ce mécanisme et de sa régulation nécessitent l’analyse d’un grand nombre de variants rendant ces travaux chron ...
Mots clés : Traduction génétique, Expression génique, Criblage pharmacologique
Auteur : Dentz Natacha
Année de soutenance : 2021
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Caractérisation de la RNase P nucléaire de Candida glabrata et amélioration des outils d’édition de son génome
Description : Candida glabrata est une levure pathogène opportuniste, apparaissant aujourd’hui comme la deuxième cause de candidémie en Europe et en Amérique du Nord. Cette levure présente de nombreuses particularités génomiques telles que la présence de nouveaux domaines structuraux au sein d’ARN non-codants ...
Mots clés : Candida glabrata, Génomique, ARN non codants, Ribonuclease P
Auteur : Dahman Yacine
Année de soutenance : 2018
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Caractérisation des modifications post-transcriptionnelles des ARN non codants chez Staphylococcus aureus en réponse à divers stress environnementaux : analyse dynamique et fonctionnelle
Description : Les modifications post-transcriptionnelles des ARN sont impliquées dans de nombreux processus biologiques. Elles sont constitutives ou modulées en réponse à des processus adaptatifs et remplissent de nombreuses fonctions. La cartographie des modifications dans les ARN du pathogène S. aureus, res ...
Mots clés : ARN -- Modifications posttranscriptionnelles, Staphylocoque doré, Résistance au stress, ARN non codants
Auteur : Antoine Laura
Année de soutenance : 2021
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Caractérisation du potentiel régulateur du facteur de transcription ZNF143
Description : Des données suggéraient que le facteur de transcription ZNF143 régule l’expression de milliers de gènes mais très peu d’informations étaient disponibles sur les gènes cibles, réseaux de gènes, processus biologiques et mécanismes impliquant ZNF143. Pour mon travail de thèse je me suis intéressé au ...
Mots clés : Transcription génétique, Facteurs de transcription, Interactions ADN-protéine, Génomique, Transcriptome
Auteur : Ngondo Richard Patryk
Année de soutenance : 2013
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Caractérisation du potentiel régulateur du facteur de transcription ZNF143
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Caractérisation moléculaire du mécanisme de dégradation des microARN par un transcrit cible
Description : La littérature indique que les miARN sont régulés à plusieurs niveaux de leur biogenèse et de leur activité. Cependant, il existe très peu d’information concernant la régulation de la stabilité des miARN. Le projet de thèse a consisté à étudier la dégradation spécifique d’un miRNA cellulaire (miR-27) ...
Mots clés : MicroARN, Régulation génétique, Infections à cytomégalovirus, Protéomique, Stabilité de l'ARN
Auteur : Cetin Semih
Année de soutenance : 2016
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Coévolution dans le gène pol du VIH-1 : un carrefour aux frontières de nouvelles espèces du VIH
Description : L’intégrase (IN) est l’une des enzymes virales assurant la réplication du VIH. La fonctionnalité des protéines qui, comme celles du VIH, ont une variabilité de séquence repose sur des résidus non conservés, en plus des acides aminés conservés entre souches, qui ont un rôle important notamment lo ...
Mots clés : Intégrase du VIH, Transcription génétique, Coévolution, Transcription inverse
Auteur : Kanja Marine
Année de soutenance : 2017
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Comprendre la flexibilité génétique de la protéine d’enveloppe de VIH-1 à travers l’étude du réseau de coévolution de ses acides aminés
Description : Une des caractéristiques du Virus de l’Immunodéficience Humaine de type 1 (VIH-1) est sa diversification génétique extensive, qui lui permet d’échapper au système immunitaire. Néanmoins, il est nécessaire que le taux de mutation requis pour à cette évolution rapide ne compromette pas la fonctionnalité ...
Mots clés : VIH (virus), Glycoprotéine 120, Recombinaison génétique, Coévolution, Protéine d'enveloppe gp120 du VIH, Protéine d'enveloppe gp160 du VIH
Auteur : Gasser Romain
Année de soutenance : 2016
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Contrôle traductionnel des facteurs de restriction APOBEC3G/F par la protéine Vif du VIH-1
Description : Le VIH-1, via sa protéine Vif, contrecarre l’activité des facteurs de restriction A3G et A3F de plusieurs manières dont l’inhibition traductionnelle. Nous avons démontré que cette répression traductionnelle d’A3G par Vif est spécifique de la région 5’UTR. De plus, une séquence uORF contenue dans ...
Mots clés : VIH (virus), Protéines virales, Traduction génétique, Produits du gène vif du virus de l'immunodéficience humaine
Auteur : Libre Camille
Année de soutenance : 2016
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Des ARN non-codants au cœur du métabolisme des sucres : nouveaux mécanismes et impact sur l'adaptation et la virulence
Description : Staphylococcus aureus un pathogène opportuniste de l’homme responsable de nombreuses maladies. Son pouvoir pathogène est dû à l’expression de nombreux facteurs de virulence, aussi qu’à sa capacité de s’adapter à son environnement. En pénétrant dans nos tissus S. aureus doit, pour survivre, faire ...
Mots clés : Staphylocoque doré, Facteurs de transcription, Petit ARN interférent, Glucides -- Métabolisme
Auteur : Mege-Bronesky Delphine
Année de soutenance : 2017
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Des ARN non-codants au cœur du métabolisme des sucres : nouveaux mécanismes et impact sur l'adaptation et la virulence
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Développement d'une approche microfluidique pour l'étude de la cinétique de repliement de l'ARN
Description : Les riboswitches sont des modules structurés dans les régions 5’ (voire 3’) UTR des ARNm. Chaque riboswitch reconnaît spécifiquement un petit métabolite, ce qui provoque un changement de conformation et permet de moduler au niveau transcriptionnel ou traductionnel (voire par épissage alternatif) ...
Mots clés : ARN messagers, Riborégulateurs, Structure moléculaire, Épissage (génétique), Plantes -- Régulation génétique, Microfluidique
Auteur : Guedich Sondes
Année de soutenance : 2012
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Double approche à la thérapie anti-tumorale à l'aide de vecteurs lentiviraux
Description : Le traitement du cancer par thérapie génique nécessite d’une part des gènes suicides efficaces et, d’autre part, l’adressage spécifique de ces gènes aux cellules cancéreuses. J'ai d'abord caractérisé un nouveau gène suicide dérivé de la désoxycytidine kinase humaine (dCK) : le M36. Comparé à la ...
Mots clés : Cancer, Marqueurs tumoraux, Transduction, Gènes-suicide transgéniques, Produits du gène env du virus de l'immunodéficience humaine
Auteur : Coulibaly Tata Safiatou
Année de soutenance : 2017
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Double approche à la thérapie anti-tumorale à l'aide de vecteurs lentiviraux
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Etude biochimique et structurale des complexes MARS de plasmodium
Description : Plasmodium est le parasite qui cause le paludisme. L’équipe a mis en évidence, in vitro, l’import d’ARNt exogène et a identifié un transporteur potentiel : la protéine tRip (tRNA import protein). In vitro, tRip lie tous les ARNt en reconnaissant leur structure. In vivo, tRip est une protéine tra ...
Mots clés : Plasmodies, Aminoacyl-ARNt synthétases, Paludisme
Auteur : Jaramillo Ponce José Refugio
Année de soutenance : 2020
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Etude biochimique et structurale des complexes MARS de plasmodium
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Etude de la régulation de l'expression des microARN de l'herpesvirus associé au sarcome de Kaposi
Description : La dérégulation de l’expression des microARN peut induire des cancers. De plus, ils jouent un rôle crucial dans la pathogénèse et la survie des virus. L’herpès virus humain de type 8 (HHV-8 ou KSHV) est l’agent étiologique du sarcome de Kaposi et est impliqué dans la génération de lymphomes agressifs ...
Mots clés : Herpèsvirus humain 8, Régulation génétique, MicroARN, Apoptose, Cancérogenèse virale, Sarcome de Kaposi
Auteur : Contrant Maud
Année de soutenance : 2014
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Etude de la régulation de l'expression des microARN de l'herpesvirus associé au sarcome de Kaposi
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Etude des réseaux de reconnaissance biomoléculaire à l'échelle atomique pour les systèmes ARN et ARN/protéines
Description : Mis à part les liaisons hydrogène, d’autres interactions non covalentes participent dans les réseaux de reconnaissance ARN et ARN protéines. Parmi celles-ci, j’ai étudié les interactions oxygène-pi. Cette interaction prend la forme phosphate-pi dans les U turns et O4'-pi dans les motifs ARN-Z. Je ...
Mots clés : Reconnaissance moléculaire, Interactions ARN-protéine, Bioinformatique structurale, Pliage de l'ARN
Auteur : D'Ascenzo Luigi
Année de soutenance : 2016
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Etude des réseaux de reconnaissance biomoléculaire à l'échelle atomique pour les systèmes ARN et ARN/protéines
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