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Amélioration et criblages de propriétés d'ARN aptamères fluorogènes en systèmes microfluidiques
Description : Les ARN (Acide RiboNucléique) remplissent de nombreuses fonctions clés dans le vivant. Ils peuvent être support de l'information génétique, régulateurs de celle-ci. Visualiser ces molécules au sein d'une cellule représenterait une étape importante vers une meilleure compréhension de la régulation ...
Mots clés : Régulation génétique, Gènes marqueurs, Microfluidique, Criblage pharmacologique, Tests de criblage à haut débit
Auteur : Autour Alexis
Année de soutenance : 2018
Directeur : Ryckelynck Michaël
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Génie chimique, technologies alimentaires
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Aminoacyl-ARNt synthétases mitochondriales humaines : aspects fondamentaux et contribution à la compréhension de pathologies reliées
Description : Les aminoacyl-ARNt synthetases (aaRS) sont impliquées dans le mécanismes de la traduction. Dans les cellules humaines, il existe deux jeux de gènes nucléaires codant pour les aaRS : un pour les aaRS cytosolique (cyt), le second pour les aaRS mitochondriales (mt). Les aaRS mt sont traduites dans ...
Mots clés : Aminoacyl-ARNt synthétases, ARN de transfert, Traduction génétique, Mitochondriopathies
Auteur : Schwenzer Hagen
Année de soutenance : 2013
Directeur : Sissler Marie, Florentz Catherine
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Application des nouvelles approches de cristallisation et de cristallographie sérielle à l’étude structurale de complexes enzymes : ARNt
Description : Cette thèse porte sur deux aspects complémentaires, le développement et l’implémentation de nouvelles approches de cristallisation et de cristallographie sérielle ainsi que leur mise en œuvre dans l’étude structurale de complexes enzymes : ARNt. La cristallographie est la méthode la plus employée ...
Mots clés : Complexes multienzymatiques, Bioinformatique structurale, Cristallographie, Microfluidique
Auteur : De Wijn Raphaël
Année de soutenance : 2018
Directeur : Sauter Claude
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Biophysique et biologie structurale
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Chimie, minéralogie, cristallographie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
ARNt "manchots" : structure, fonctionnalité et évolution
Description : Les ARNt sont des molécules adaptatrices reliant l'information génétique de l’ARN messagers à la séquence d'acides aminés primaire des protéines. Les ARNt ont une structure typique, appelée "feuille de trèfle". Certains ARNt mitochondriaux montrent une forte dérivation de cette structure. Un cas ...
Mots clés : Aminoacyl-ARNt synthétases, ARN de transfert, Nématodes entomophages, Mitochondries
Auteur : Jühling Tina
Année de soutenance : 2016
Directeur : Florentz Catherine, Mörl Mario
Établissement de soutenance : Strasbourg, Universität Leipzig
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Caractérisation de l'ArgRS mitochondriale humaine et contribution à la compréhension des pathologies liées aux mutations des aminoacyl-ARNt synthétases mitochondriales
Description : Les aminoacyl-ARNt synthétases mitochondriales humaines (aaRS mt) sont des enzymes clés de la traduction mitochondriale. Elles catalysent l'aminoacylation des ARNt par les acides aminés correspondent. Des mutations dans leurs gènes sont corrélées à des pathologies avec un large spectre de phénotypes ...
Mots clés : Aminoacyl-ARNt synthétases, Mitochondries, Traduction génétique, Hypoplasie pontocérébelleuse, Amino acyl-tRNA synthetases
Auteur : Gonzalez Serrano Ligia Elena
Année de soutenance : 2018
Directeur : Sissler Marie
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Caractérisation de l'expression des éléments Alu et du phénomène d'édition de l'ARN chez l'humain et la souris
Description : Les éléments Alu sont les retrotransposons les plus prolifiques chez l’humain avec plus d’1 million de copies occupant plus de 10% du génome. Afin de contrecarrer l’expansion des rétro-éléments, les organismes ont développés différents mécanismes pour préserver l’intégrité de leurs génomes. Le plus ...
Mots clés : Éléments génétiques mobiles, Séquence nucléotidique, ARN -- Édition
Auteur : Cattenoz Pierre
Année de soutenance : 2012
Directeur : Westhof Eric, Mattick John
Établissement de soutenance : Strasbourg, University of Queensland
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Caractérisation de l’improtance d’Argonaute 2 et des microARN lors de l’infection par le cytomégalovirus murin
Description : Les micro (mi)ARN sont des régulateurs post-transcriptionnels de l’expression génique. Retrouvés chez la plupart des eucaryotes, ils sont impliqués dans un grand nombre de processus biologiques. Certains virus sont capables de détourner cette voie à leur avantage et expriment leurs propres miARN ...
Mots clés : MicroARN, Infections à cytomégalovirus, Protéines Argonaute
Auteur : Terenzi Olivier
Année de soutenance : 2019
Directeur : Pfeffer Sébastien
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Caractérisation de la machinerie traductionnelle à l'aide de criblages à ultra haut-débit en goutelettes microfluidiques
Description : La traduction est un procédé énergivore finement régulé et ce, majoritairement lors de son initiation. Que ce soit au travers de systèmes procaryotes ou eucaryotes, l’étude de ce mécanisme et de sa régulation nécessitent l’analyse d’un grand nombre de variants rendant ces travaux chron ...
Mots clés : Traduction génétique, Expression génique, Criblage pharmacologique
Auteur : Dentz Natacha
Année de soutenance : 2021
Directeur : Ryckelynck Michaël
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Caractérisation de la RNase P nucléaire de Candida glabrata et amélioration des outils d’édition de son génome
Description : Candida glabrata est une levure pathogène opportuniste, apparaissant aujourd’hui comme la deuxième cause de candidémie en Europe et en Amérique du Nord. Cette levure présente de nombreuses particularités génomiques telles que la présence de nouveaux domaines structuraux au sein d’ARN non-codants ...
Mots clés : Candida glabrata, Génomique, ARN non codants, Ribonuclease P
Auteur : Dahman Yacine
Année de soutenance : 2018
Directeur : Jossinet Fabrice
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Biologie moléculaire et génomique
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Caractérisation des modifications post-transcriptionnelles des ARN non codants chez Staphylococcus aureus en réponse à divers stress environnementaux : analyse dynamique et fonctionnelle
Description : Les modifications post-transcriptionnelles des ARN sont impliquées dans de nombreux processus biologiques. Elles sont constitutives ou modulées en réponse à des processus adaptatifs et remplissent de nombreuses fonctions. La cartographie des modifications dans les ARN du pathogène S. aureus, res ...
Mots clés : ARN -- Modifications posttranscriptionnelles, Staphylocoque doré, Résistance au stress, ARN non codants
Auteur : Antoine Laura
Année de soutenance : 2021
Directeur : Marzi Stefano
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Caractérisation du potentiel régulateur du facteur de transcription ZNF143
Description : Des données suggéraient que le facteur de transcription ZNF143 régule l’expression de milliers de gènes mais très peu d’informations étaient disponibles sur les gènes cibles, réseaux de gènes, processus biologiques et mécanismes impliquant ZNF143. Pour mon travail de thèse je me suis intéressé au ...
Mots clés : Transcription génétique, Facteurs de transcription, Interactions ADN-protéine, Génomique, Transcriptome
Auteur : Ngondo Richard Patryk
Année de soutenance : 2013
Restriction d'accès permanente : confidentialité ou accès intranet uniquement    Restriction d'accès permanente : confidentialité ou accès intranet uniquement
Directeur : Carbon Philippe
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Caractérisation du rôle de l’exoribonucléase DIS3L2 et du complexe protéique SKI lors d’une infection virale
Description : Chez les eucaryotes, les voies de dégradation des ARN régulent l'abondance des transcrits et assurent un contrôle qualité en éliminant les ARN défectueux. Le complexe SKI agit dans le cytoplasme en tant que co-facteur de l'exosome, stimulant la dégradation des ARN par leur extrémité 3'. La ARN de ...
Mots clés : Cellules eucaryotes, Virus à ARN monocaténaire, Ribonucléases
Auteur : Amrani Yasmine
Année de soutenance : 2023
Accès restreint jusqu'au 31-12-2024 (confidentialité ou accès intranet)    Accès restreint jusqu'au 31-12-2024 (confidentialité ou accès intranet)
Directeur : Pfeffer Sébastien, Séraphin Bertrand
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Caractérisation moléculaire du mécanisme de dégradation des microARN par un transcrit cible
Description : La littérature indique que les miARN sont régulés à plusieurs niveaux de leur biogenèse et de leur activité. Cependant, il existe très peu d’information concernant la régulation de la stabilité des miARN. Le projet de thèse a consisté à étudier la dégradation spécifique d’un miRNA cellulaire (miR-27) ...
Mots clés : MicroARN, Régulation génétique, Infections à cytomégalovirus, Protéomique, Stabilité de l'ARN
Auteur : Cetin Semih
Année de soutenance : 2016
Directeur : Pfeffer Sébastien
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Coévolution dans le gène pol du VIH-1 : un carrefour aux frontières de nouvelles espèces du VIH
Description : L’intégrase (IN) est l’une des enzymes virales assurant la réplication du VIH. La fonctionnalité des protéines qui, comme celles du VIH, ont une variabilité de séquence repose sur des résidus non conservés, en plus des acides aminés conservés entre souches, qui ont un rôle important notamment lo ...
Mots clés : Intégrase du VIH, Transcription génétique, Coévolution, Transcription inverse
Auteur : Kanja Marine
Année de soutenance : 2017
Directeur : Negroni Matteo
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Comprendre la flexibilité génétique de la protéine d’enveloppe de VIH-1 à travers l’étude du réseau de coévolution de ses acides aminés
Description : Une des caractéristiques du Virus de l’Immunodéficience Humaine de type 1 (VIH-1) est sa diversification génétique extensive, qui lui permet d’échapper au système immunitaire. Néanmoins, il est nécessaire que le taux de mutation requis pour à cette évolution rapide ne compromette pas la fonctionnalité ...
Mots clés : VIH (virus), Glycoprotéine 120, Recombinaison génétique, Coévolution, Protéine d'enveloppe gp120 du VIH, Protéine d'enveloppe gp160 du VIH
Auteur : Gasser Romain
Année de soutenance : 2016
Directeur : Negroni Matteo
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Virologie : aspects moléculaires et médicaux
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Contribution des SPATEs SigA et SepA dans la survie de Shigella dans le plasma
Description : Les Shigella sont les pathogènes responsables de la shigellose, caractérisée par de la fièvre, une diarrhée hémorragique et dans les cas les plus graves, une bactériémie. Ainsi, les Shigella sont exposées au sang mais les mécanismes qui permettent à ces bactéries de s’adapter et de survivre à l’ ...
Mots clés : Shigelles, Virulence (microbiologie), Sérine-protéases
Auteur : Debande Lorine
Année de soutenance : 2023
Directeur : Marteyn Benoît
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Microbiologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Contrôle traductionnel des facteurs de restriction APOBEC3G/F par la protéine Vif du VIH-1
Description : Le VIH-1, via sa protéine Vif, contrecarre l’activité des facteurs de restriction A3G et A3F de plusieurs manières dont l’inhibition traductionnelle. Nous avons démontré que cette répression traductionnelle d’A3G par Vif est spécifique de la région 5’UTR. De plus, une séquence uORF contenue dans ...
Mots clés : VIH (virus), Protéines virales, Traduction génétique, Produits du gène vif du virus de l'immunodéficience humaine
Auteur : Libre Camille
Année de soutenance : 2016
Directeur : Paillart Jean-Christophe
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Des ARN non-codants au cœur du métabolisme des sucres : nouveaux mécanismes et impact sur l'adaptation et la virulence
Description : Staphylococcus aureus un pathogène opportuniste de l’homme responsable de nombreuses maladies. Son pouvoir pathogène est dû à l’expression de nombreux facteurs de virulence, aussi qu’à sa capacité de s’adapter à son environnement. En pénétrant dans nos tissus S. aureus doit, pour survivre, faire ...
Mots clés : Staphylocoque doré, Facteurs de transcription, Petits ARN interférents, Glucides -- Métabolisme
Auteur : Mege-Bronesky Delphine
Année de soutenance : 2017
Directeur : Romby Pascale
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Développement d'une approche microfluidique pour l'étude de la cinétique de repliement de l'ARN
Description : Les riboswitches sont des modules structurés dans les régions 5’ (voire 3’) UTR des ARNm. Chaque riboswitch reconnaît spécifiquement un petit métabolite, ce qui provoque un changement de conformation et permet de moduler au niveau transcriptionnel ou traductionnel (voire par épissage alternatif) ...
Mots clés : ARN messagers, Riborégulateurs, Structure moléculaire, Épissage (génétique), Plantes -- Régulation génétique, Microfluidique
Auteur : Guedich Sondes
Année de soutenance : 2012
Restriction d'accès permanente : confidentialité ou accès intranet uniquement    Restriction d'accès permanente : confidentialité ou accès intranet uniquement
Directeur : Burnouf Dominique, Dumas Philippe, Mejdoub Hafedh
Établissement de soutenance : Strasbourg, Université de Sfax (Tunisie)
Discipline : Biophysique et biologie structurale
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Développement de glycoprotéines d’enveloppe du virus Sindbis pour les virothérapies anticancéreuses
Description : Les traitements anticancéreux traditionnels sont souvent insuffisants pour faire face à l’apparition de cellules résistantes, comme c’est le cas des cellules α5β1z+ des glioblastomes. Bien que l’intérêt des nouvelles stratégies, telles que les virothérapies, visant l’élimination spécifiques des ...
Mots clés : Glioblastome, Virothérapie oncolytique, Glycoprotéines
Auteur : Duvergé Alexis
Année de soutenance : 2023
Accès restreint jusqu'au 05-07-2028 (confidentialité ou accès intranet)    Accès restreint jusqu'au 05-07-2028 (confidentialité ou accès intranet)
Directeur : Negroni Matteo
Établissement de soutenance : Strasbourg
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Thème : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé
Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)